Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc57Q6PHN1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc57Q6PHN1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc57Q6PHN1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc57Q6PHN1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc57Q6PHN1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc57Q6PHN1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc57Q6PHN1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc57Q6PHN1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc57Q6PHN1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc57Q6PHN1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc57Q6PHN1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc57Q6PHN1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc57Q6PHN1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc57Q6PHN1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc57Q6PHN1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc57Q6PHN1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc57Q6PHN1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc57Q6PHN1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc57Q6PHN1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc57Q6PHN1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc57Q6PHN1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc57Q6PHN1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc57Q6PHN1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc57Q6PHN1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc57Q6PHN1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc57Q6PHN1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc57Q6PHN1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc57Q6PHN1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc57Q6PHN1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc57Q6PHN1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc57Q6PHN1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc57Q6PHN1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc57Q6PHN1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc57Q6PHN1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc57Q6PHN1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc57Q6PHN1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc57Q6PHN1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc57Q6PHN1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc57Q6PHN1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc57Q6PHN1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc57Q6PHN1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc57Q6PHN1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc57Q6PHN1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc57Q6PHN1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc57Q6PHN1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc57Q6PHN1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc57Q6PHN1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc57Q6PHN1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc57Q6PHN1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc57Q6PHN1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc57Q6PHN1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc57Q6PHN1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc57Q6PHN1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc57Q6PHN1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc57Q6PHN1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc57Q6PHN1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc57Q6PHN1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc57Q6PHN1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc57Q6PHN1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc57Q6PHN1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc57Q6PHN1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc57Q6PHN1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc57Q6PHN1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc57Q6PHN1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc57Q6PHN1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc57Q6PHN1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc57Q6PHN1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc57Q6PHN1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc57Q6PHN1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc57Q6PHN1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc57Q6PHN1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc57Q6PHN1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc57Q6PHN1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms