Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRNQ16849 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRNQ16849 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRNQ16849 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRNQ16849 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRNQ16849 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRNQ16849 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRNQ16849 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRNQ16849 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRNQ16849 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRNQ16849 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPRNQ16849 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRNQ16849 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRNQ16849 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRNQ16849 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRNQ16849 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRNQ16849 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRNQ16849 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRNQ16849 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRNQ16849 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRNQ16849 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRNQ16849 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRNQ16849 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRNQ16849 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRNQ16849 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRNQ16849 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRNQ16849 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRNQ16849 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRNQ16849 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRNQ16849 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRNQ16849 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRNQ16849 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRNQ16849 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRNQ16849 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRNQ16849 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRNQ16849 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRNQ16849 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRNQ16849 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRNQ16849 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRNQ16849 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRNQ16849 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRNQ16849 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRNQ16849 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRNQ16849 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRNQ16849 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRNQ16849 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRNQ16849 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRNQ16849 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRNQ16849 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRNQ16849 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRNQ16849 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRNQ16849 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRNQ16849 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRNQ16849 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRNQ16849 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRNQ16849 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRNQ16849 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRNQ16849 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRNQ16849 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRNQ16849 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRNQ16849 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRNQ16849 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRNQ16849 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRNQ16849 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRNQ16849 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRNQ16849 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRNQ16849 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRNQ16849 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRNQ16849 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRNQ16849 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRNQ16849 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRNQ16849 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRNQ16849 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRNQ16849 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRNQ16849 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRNQ16849 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRNQ16849 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRNQ16849 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRNQ16849 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRNQ16849 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRNQ16849 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRNQ16849 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRNQ16849 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRNQ16849 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRNQ16849 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRNQ16849 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRNQ16849 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRNQ16849 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRNQ16849 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRNQ16849 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRNQ16849 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRNQ16849 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRNQ16849 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRNQ16849 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRNQ16849 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRNQ16849 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRNQ16849 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRNQ16849 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRNQ16849 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRNQ16849 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
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