Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cab39Q06138 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cab39Q06138 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cab39Q06138 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cab39Q06138 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cab39Q06138 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cab39Q06138 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cab39Q06138 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cab39Q06138 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cab39Q06138 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cab39Q06138 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cab39Q06138 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cab39Q06138 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cab39Q06138 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cab39Q06138 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cab39Q06138 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cab39Q06138 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cab39Q06138 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cab39Q06138 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cab39Q06138 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cab39Q06138 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cab39Q06138 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cab39Q06138 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cab39Q06138 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cab39Q06138 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cab39Q06138 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cab39Q06138 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cab39Q06138 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cab39Q06138 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cab39Q06138 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cab39Q06138 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cab39Q06138 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cab39Q06138 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cab39Q06138 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cab39Q06138 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cab39Q06138 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cab39Q06138 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cab39Q06138 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cab39Q06138 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cab39Q06138 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cab39Q06138 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cab39Q06138 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cab39Q06138 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cab39Q06138 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cab39Q06138 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cab39Q06138 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cab39Q06138 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cab39Q06138 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cab39Q06138 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms