Protein–RNA interactions for Protein: P55292

Dsc2, Desmocollin-2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc2P55292 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsc2P55292 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dsc2P55292 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dsc2P55292 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dsc2P55292 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dsc2P55292 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dsc2P55292 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dsc2P55292 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dsc2P55292 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsc2P55292 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsc2P55292 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsc2P55292 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dsc2P55292 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsc2P55292 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsc2P55292 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsc2P55292 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsc2P55292 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dsc2P55292 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsc2P55292 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsc2P55292 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dsc2P55292 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Dsc2P55292 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dsc2P55292 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dsc2P55292 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dsc2P55292 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dsc2P55292 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dsc2P55292 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms