Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HARS2P49590 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HARS2P49590 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HARS2P49590 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HARS2P49590 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HARS2P49590 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HARS2P49590 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HARS2P49590 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HARS2P49590 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HARS2P49590 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HARS2P49590 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HARS2P49590 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HARS2P49590 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HARS2P49590 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HARS2P49590 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HARS2P49590 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HARS2P49590 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HARS2P49590 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HARS2P49590 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HARS2P49590 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HARS2P49590 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HARS2P49590 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HARS2P49590 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HARS2P49590 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HARS2P49590 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HARS2P49590 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HARS2P49590 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HARS2P49590 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HARS2P49590 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HARS2P49590 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HARS2P49590 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HARS2P49590 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HARS2P49590 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HARS2P49590 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HARS2P49590 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HARS2P49590 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HARS2P49590 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HARS2P49590 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HARS2P49590 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HARS2P49590 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HARS2P49590 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HARS2P49590 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HARS2P49590 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HARS2P49590 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HARS2P49590 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HARS2P49590 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HARS2P49590 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HARS2P49590 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HARS2P49590 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HARS2P49590 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HARS2P49590 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HARS2P49590 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HARS2P49590 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HARS2P49590 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HARS2P49590 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HARS2P49590 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HARS2P49590 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HARS2P49590 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HARS2P49590 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HARS2P49590 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HARS2P49590 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HARS2P49590 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HARS2P49590 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HARS2P49590 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HARS2P49590 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HARS2P49590 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HARS2P49590 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HARS2P49590 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HARS2P49590 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HARS2P49590 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HARS2P49590 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HARS2P49590 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HARS2P49590 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HARS2P49590 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HARS2P49590 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HARS2P49590 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HARS2P49590 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HARS2P49590 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HARS2P49590 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HARS2P49590 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HARS2P49590 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HARS2P49590 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HARS2P49590 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HARS2P49590 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HARS2P49590 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HARS2P49590 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HARS2P49590 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HARS2P49590 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HARS2P49590 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HARS2P49590 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HARS2P49590 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HARS2P49590 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HARS2P49590 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HARS2P49590 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HARS2P49590 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HARS2P49590 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HARS2P49590 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HARS2P49590 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HARS2P49590 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HARS2P49590 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms