Protein–RNA interactions for Protein: P46978

Stt3a, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3aP46978 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stt3aP46978 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stt3aP46978 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stt3aP46978 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stt3aP46978 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stt3aP46978 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stt3aP46978 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stt3aP46978 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stt3aP46978 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stt3aP46978 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stt3aP46978 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stt3aP46978 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stt3aP46978 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stt3aP46978 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stt3aP46978 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stt3aP46978 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stt3aP46978 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stt3aP46978 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stt3aP46978 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stt3aP46978 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stt3aP46978 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stt3aP46978 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stt3aP46978 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stt3aP46978 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stt3aP46978 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stt3aP46978 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stt3aP46978 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stt3aP46978 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stt3aP46978 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stt3aP46978 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Stt3aP46978 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Stt3aP46978 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stt3aP46978 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stt3aP46978 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Stt3aP46978 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stt3aP46978 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Stt3aP46978 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.5 ms