Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD40LGP29965 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD40LGP29965 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD40LGP29965 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD40LGP29965 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD40LGP29965 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD40LGP29965 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD40LGP29965 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD40LGP29965 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD40LGP29965 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD40LGP29965 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD40LGP29965 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD40LGP29965 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD40LGP29965 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD40LGP29965 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD40LGP29965 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD40LGP29965 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD40LGP29965 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CD40LGP29965 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD40LGP29965 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD40LGP29965 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD40LGP29965 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD40LGP29965 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD40LGP29965 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD40LGP29965 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD40LGP29965 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CD40LGP29965 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD40LGP29965 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD40LGP29965 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD40LGP29965 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms