Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NSD2O96028 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NSD2O96028 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NSD2O96028 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NSD2O96028 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NSD2O96028 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NSD2O96028 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NSD2O96028 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NSD2O96028 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NSD2O96028 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NSD2O96028 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NSD2O96028 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NSD2O96028 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NSD2O96028 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NSD2O96028 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NSD2O96028 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NSD2O96028 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
NSD2O96028 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NSD2O96028 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NSD2O96028 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NSD2O96028 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NSD2O96028 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
NSD2O96028 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NSD2O96028 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NSD2O96028 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NSD2O96028 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NSD2O96028 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NSD2O96028 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
NSD2O96028 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NSD2O96028 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
NSD2O96028 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NSD2O96028 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NSD2O96028 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NSD2O96028 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NSD2O96028 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NSD2O96028 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NSD2O96028 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NSD2O96028 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NSD2O96028 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NSD2O96028 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NSD2O96028 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NSD2O96028 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NSD2O96028 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NSD2O96028 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NSD2O96028 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NSD2O96028 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NSD2O96028 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NSD2O96028 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NSD2O96028 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NSD2O96028 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NSD2O96028 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
NSD2O96028 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NSD2O96028 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NSD2O96028 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NSD2O96028 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NSD2O96028 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NSD2O96028 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
NSD2O96028 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NSD2O96028 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NSD2O96028 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NSD2O96028 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NSD2O96028 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NSD2O96028 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NSD2O96028 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NSD2O96028 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NSD2O96028 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NSD2O96028 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NSD2O96028 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NSD2O96028 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NSD2O96028 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NSD2O96028 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NSD2O96028 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NSD2O96028 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NSD2O96028 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NSD2O96028 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NSD2O96028 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NSD2O96028 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NSD2O96028 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NSD2O96028 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
NSD2O96028 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NSD2O96028 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NSD2O96028 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NSD2O96028 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NSD2O96028 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NSD2O96028 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NSD2O96028 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NSD2O96028 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
NSD2O96028 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NSD2O96028 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NSD2O96028 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
NSD2O96028 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NSD2O96028 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NSD2O96028 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NSD2O96028 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
NSD2O96028 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
NSD2O96028 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NSD2O96028 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NSD2O96028 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NSD2O96028 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NSD2O96028 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms