RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627453.2

ABCA9-AS1-202, ABCA9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene ABCA9-AS1, Length 656 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.85■■■□□ 2.05
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 FOXD1Q16676 465 aa23.25■■□□□ 1.31
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.26■■□□□ 1.15
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.86■■□□□ 1.09
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 ADRA2BP18089 450 aa21.79■■□□□ 1.08
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 MSH5O43196 834 aa21.6■■□□□ 1.05
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 POTEDQ86YR6 584 aa21.02■□□□□ 0.96
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
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ABCA9-AS1-202ENST00000627453 DMRT2Q9Y5R5 561 aa19.75■□□□□ 0.75
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa19.58■□□□□ 0.72
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa19.14■□□□□ 0.65
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 DCAF8L1A6NGE4 600 aa19.01■□□□□ 0.63
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
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ABCA9-AS1-202ENST00000627453 RNF39Q9H2S5 420 aa18.5■□□□□ 0.55
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 KCNA4P22459 653 aa18.39■□□□□ 0.53
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.26■□□□□ 0.51
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.18■□□□□ 0.5
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 SLC4A2P04920 1241 aa17.76■□□□□ 0.43
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 CAPN15O75808 1086 aa17.52■□□□□ 0.4
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 DSG3P32926 999 aa17.37■□□□□ 0.37
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 TRHP20396 242 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
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ABCA9-AS1-202ENST00000627453 APLP2Q06481 763 aa17.2■□□□□ 0.34
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 ABCB7O75027 752 aa17.19■□□□□ 0.34
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 FOXD4L1Q9NU39 408 aa17.05■□□□□ 0.32
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 ZBTB22O15209 634 aa16.95■□□□□ 0.3
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 POLA2Q14181 598 aa16.82■□□□□ 0.28
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.56■□□□□ 0.24
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 POTEHQ6S545 545 aa16.47■□□□□ 0.23
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 ATXN8OSP0DMR3 200 aa16.43■□□□□ 0.22
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 OSCARQ8IYS5 282 aa16.33■□□□□ 0.2
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ABCA9-AS1-202ENST00000627453 CHRDL2Q6WN34 429 aa16.17■□□□□ 0.18
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 AKT1S1Q96B36 256 aa16.16■□□□□ 0.18
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 FBLN2P98095 1184 aa16.06■□□□□ 0.16
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 PITPNM1O00562 1244 aa15.93■□□□□ 0.14
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 SPDYE2BA6NHP3 402 aa15.92■□□□□ 0.14
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 SPDYE6P0CI01 402 aa15.92■□□□□ 0.14
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 SPDYE2Q495Y8 402 aa15.92■□□□□ 0.14
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 PIP4P2Q8N4L2 257 aa15.83■□□□□ 0.12
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ABCA9-AS1-202ENST00000627453 SSUH2Q9Y2M2 353 aa15.76■□□□□ 0.11
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP15.7■□□□□ 0.1
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 CLEC11AQ9Y240 323 aa15.68■□□□□ 0.1
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP15.59■□□□□ 0.09
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 HAX1O00165 279 aa15.5■□□□□ 0.07
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 CHADLQ6NUI6 762 aa15.42■□□□□ 0.06
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 EVX2Q03828 476 aa15.39■□□□□ 0.05
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 PRR29P0C7W0 189 aa15.37■□□□□ 0.05
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 SPDYE4A6NLX3 237 aa15.31■□□□□ 0.04
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 C19orf67A6NJJ6 358 aa15.21■□□□□ 0.03
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 STAG3Q9UJ98 1225 aa15.07■□□□□ 0
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 CREBZFQ9NS37 354 aa15.05■□□□□ -0
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 CD44P16070 742 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 GABBR2O75899 941 aa14.98□□□□□ -0.01
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 PROM2Q8N271 834 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 ZRANB1Q9UGI0 708 aa14.81□□□□□ -0.04
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 FKBP8Q14318 412 aa14.76□□□□□ -0.05
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 POTEIP0CG38 1075 aa14.71□□□□□ -0.05
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 PHF12Q96QT6 1004 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 CLCN6P51797 869 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 MIER1Q8N108 512 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 DCBLD2Q96PD2 775 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 LHX8Q68G74 356 aa14.52□□□□□ -0.09
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 PLEKHG5O94827 1062 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 MS4A3Q96HJ5 214 aa14.46□□□□□ -0.09
ABCA9-AS1-202ENST00000627453 RASEFQ8IZ41 740 aa14.45□□□□□ -0.1
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