RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623635.1

PTPRQ-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRQ, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-210ENST00000623635 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
PTPRQ-210ENST00000623635 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.58■■■□□ 2.81
PTPRQ-210ENST00000623635 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
PTPRQ-210ENST00000623635 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
PTPRQ-210ENST00000623635 FOXD1Q16676 465 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPRQ-210ENST00000623635 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRQ-210ENST00000623635 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRQ-210ENST00000623635 ADRA2BP18089 450 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRQ-210ENST00000623635 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
PTPRQ-210ENST00000623635 MSH5O43196 834 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRQ-210ENST00000623635 POTEDQ86YR6 584 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRQ-210ENST00000623635 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRQ-210ENST00000623635 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
PTPRQ-210ENST00000623635 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
PTPRQ-210ENST00000623635 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRQ-210ENST00000623635 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRQ-210ENST00000623635 KCNA4P22459 653 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRQ-210ENST00000623635 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PTPRQ-210ENST00000623635 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRQ-210ENST00000623635 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRQ-210ENST00000623635 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPRQ-210ENST00000623635 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRQ-210ENST00000623635 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRQ-210ENST00000623635 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
PTPRQ-210ENST00000623635 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.13■□□□□ 0.97
PTPRQ-210ENST00000623635 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
PTPRQ-210ENST00000623635 SLC4A2P04920 1241 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRQ-210ENST00000623635 RNF39Q9H2S5 420 aa21.05■□□□□ 0.96
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PTPRQ-210ENST00000623635 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
PTPRQ-210ENST00000623635 ZBTB22O15209 634 aa20.66■□□□□ 0.9
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PTPRQ-210ENST00000623635 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PTPRQ-210ENST00000623635 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRQ-210ENST00000623635 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PTPRQ-210ENST00000623635 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PTPRQ-210ENST00000623635 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PTPRQ-210ENST00000623635 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRQ-210ENST00000623635 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PTPRQ-210ENST00000623635 CAPN15O75808 1086 aa20.22■□□□□ 0.83
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PTPRQ-210ENST00000623635 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
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PTPRQ-210ENST00000623635 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
PTPRQ-210ENST00000623635 ABCB7O75027 752 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRQ-210ENST00000623635 ATXN8OSP0DMR3 200 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRQ-210ENST00000623635 POLA2Q14181 598 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRQ-210ENST00000623635 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
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PTPRQ-210ENST00000623635 POTEHQ6S545 545 aa18.93■□□□□ 0.62
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PTPRQ-210ENST00000623635 AKT1S1Q96B36 256 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRQ-210ENST00000623635 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
PTPRQ-210ENST00000623635 SSUH2Q9Y2M2 353 aa18.59■□□□□ 0.57
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PTPRQ-210ENST00000623635 SPDYE4A6NLX3 237 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRQ-210ENST00000623635 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.42■□□□□ 0.54
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PTPRQ-210ENST00000623635 PITPNM1O00562 1244 aa18.36■□□□□ 0.53
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PTPRQ-210ENST00000623635 CLEC11AQ9Y240 323 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRQ-210ENST00000623635 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
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PTPRQ-210ENST00000623635 PIP4P2Q8N4L2 257 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRQ-210ENST00000623635 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP18.03■□□□□ 0.48
PTPRQ-210ENST00000623635 PRR29P0C7W0 189 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRQ-210ENST00000623635 STAG3Q9UJ98 1225 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRQ-210ENST00000623635 CHADLQ6NUI6 762 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRQ-210ENST00000623635 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
PTPRQ-210ENST00000623635 CREBZFQ9NS37 354 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRQ-210ENST00000623635 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
PTPRQ-210ENST00000623635 HAX1O00165 279 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRQ-210ENST00000623635 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
PTPRQ-210ENST00000623635 FBXO3Q9UK99 471 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRQ-210ENST00000623635 MIER1Q8N108 512 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRQ-210ENST00000623635 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
PTPRQ-210ENST00000623635 PLCD3Q8N3E9 789 aa17.5■□□□□ 0.39
PTPRQ-210ENST00000623635 EVX2Q03828 476 aa17.48■□□□□ 0.39
PTPRQ-210ENST00000623635 VASPP50552 380 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
PTPRQ-210ENST00000623635 C19orf67A6NJJ6 358 aa17.43■□□□□ 0.38
PTPRQ-210ENST00000623635 PLEKHG5O94827 1062 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRQ-210ENST00000623635 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP17.34■□□□□ 0.37
PTPRQ-210ENST00000623635 CD44P16070 742 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
PTPRQ-210ENST00000623635 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
PTPRQ-210ENST00000623635 KLHL34Q8N239 644 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRQ-210ENST00000623635 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
PTPRQ-210ENST00000623635 RASEFQ8IZ41 740 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRQ-210ENST00000623635 ZRANB1Q9UGI0 708 aa17.2■□□□□ 0.34
PTPRQ-210ENST00000623635 NUBP1P53384 320 aa17.19■□□□□ 0.34
PTPRQ-210ENST00000623635 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
PTPRQ-210ENST00000623635 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
PTPRQ-210ENST00000623635 PHF12Q96QT6 1004 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRQ-210ENST00000623635 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
PTPRQ-210ENST00000623635 GABBR2O75899 941 aa17.04■□□□□ 0.32
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