RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584710.5

DCC-218, Transcript of DCC netrin 1 receptor, humanhuman

TSL 2

Gene DCC, Length 374 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCC-218ENST00000584710 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.45■□□□□ 0.86
DCC-218ENST00000584710 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
DCC-218ENST00000584710 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
DCC-218ENST00000584710 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
DCC-218ENST00000584710 PLPPR3Q6T4P5 718 aa16.84■□□□□ 0.29
DCC-218ENST00000584710 FOXD1Q16676 465 aa16.05■□□□□ 0.16
DCC-218ENST00000584710 ADRA2BP18089 450 aa15.73■□□□□ 0.11
DCC-218ENST00000584710 PPP6R1Q9UPN7 881 aa15.69■□□□□ 0.1
DCC-218ENST00000584710 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
DCC-218ENST00000584710 KCNA4P22459 653 aa14.87□□□□□ -0.03
DCC-218ENST00000584710 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.84□□□□□ -0.03
DCC-218ENST00000584710 MSH5O43196 834 aa14.77□□□□□ -0.05
DCC-218ENST00000584710 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
DCC-218ENST00000584710 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
DCC-218ENST00000584710 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.39□□□□□ -0.11
DCC-218ENST00000584710 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
DCC-218ENST00000584710 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
DCC-218ENST00000584710 EHMT2Q96KQ7 1210 aa14.28□□□□□ -0.12
DCC-218ENST00000584710 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
DCC-218ENST00000584710 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
DCC-218ENST00000584710 DMRT2Q9Y5R5 561 aa13.95□□□□□ -0.18
DCC-218ENST00000584710 CSRNP3Q8WYN3 585 aa13.94□□□□□ -0.18
DCC-218ENST00000584710 DNAJC5BQ9UF47 199 aa13.94□□□□□ -0.18
DCC-218ENST00000584710 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
DCC-218ENST00000584710 FOXD4L1Q9NU39 408 aa13.66□□□□□ -0.22
DCC-218ENST00000584710 ZBTB22O15209 634 aa13.62□□□□□ -0.23
DCC-218ENST00000584710 SLC4A2P04920 1241 aa13.39□□□□□ -0.27
DCC-218ENST00000584710 DCAF8L1A6NGE4 600 aa13.33□□□□□ -0.28
DCC-218ENST00000584710 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
DCC-218ENST00000584710 ATXN8OSP0DMR3 200 aa13.22□□□□□ -0.29
DCC-218ENST00000584710 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP13.21□□□□□ -0.29
DCC-218ENST00000584710 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
DCC-218ENST00000584710 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
DCC-218ENST00000584710 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
DCC-218ENST00000584710 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
DCC-218ENST00000584710 APLP2Q06481 763 aa12.92□□□□□ -0.34
DCC-218ENST00000584710 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
DCC-218ENST00000584710 POTEDQ86YR6 584 aa12.65□□□□□ -0.38
DCC-218ENST00000584710 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
DCC-218ENST00000584710 FKBP8Q14318 412 aa12.61□□□□□ -0.39
DCC-218ENST00000584710 RNF39Q9H2S5 420 aa12.61□□□□□ -0.39
DCC-218ENST00000584710 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
DCC-218ENST00000584710 TRHP20396 242 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
DCC-218ENST00000584710 CAPN15O75808 1086 aa12.47□□□□□ -0.41
DCC-218ENST00000584710 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
DCC-218ENST00000584710 FBLN2P98095 1184 aa12.4□□□□□ -0.42
DCC-218ENST00000584710 POLA2Q14181 598 aa12.37□□□□□ -0.43
DCC-218ENST00000584710 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
DCC-218ENST00000584710 SPDYE4A6NLX3 237 aa12.27□□□□□ -0.45
DCC-218ENST00000584710 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
DCC-218ENST00000584710 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
DCC-218ENST00000584710 ABCB7O75027 752 aa12.19□□□□□ -0.46
DCC-218ENST00000584710 FBXO3Q9UK99 471 aa12.19□□□□□ -0.46
DCC-218ENST00000584710 DSG3P32926 999 aa12.13□□□□□ -0.47
DCC-218ENST00000584710 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
DCC-218ENST00000584710 PROM2Q8N271 834 aa12.08□□□□□ -0.48
DCC-218ENST00000584710 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
DCC-218ENST00000584710 SPDYE2BA6NHP3 402 aa11.96□□□□□ -0.49
DCC-218ENST00000584710 SPDYE6P0CI01 402 aa11.96□□□□□ -0.49
DCC-218ENST00000584710 SPDYE2Q495Y8 402 aa11.96□□□□□ -0.49
DCC-218ENST00000584710 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
DCC-218ENST00000584710 VASPP50552 380 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
DCC-218ENST00000584710 OSCARQ8IYS5 282 aa11.89□□□□□ -0.51
DCC-218ENST00000584710 SSUH2Q9Y2M2 353 aa11.85□□□□□ -0.51
DCC-218ENST00000584710 STAG3Q9UJ98 1225 aa11.83□□□□□ -0.52
DCC-218ENST00000584710 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP11.77□□□□□ -0.53
DCC-218ENST00000584710 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
DCC-218ENST00000584710 KLHL34Q8N239 644 aa11.67□□□□□ -0.54
DCC-218ENST00000584710 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
DCC-218ENST00000584710 PLCD3Q8N3E9 789 aa11.66□□□□□ -0.54
DCC-218ENST00000584710 PLEKHG5O94827 1062 aa11.64□□□□□ -0.55
DCC-218ENST00000584710 SLC24A1O60721 1099 aa11.63□□□□□ -0.55
DCC-218ENST00000584710 MIER1Q8N108 512 aa11.62□□□□□ -0.55
DCC-218ENST00000584710 SPOCK2Q92563 424 aa11.62□□□□□ -0.55
DCC-218ENST00000584710 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
DCC-218ENST00000584710 AKT1S1Q96B36 256 aa11.57□□□□□ -0.56
DCC-218ENST00000584710 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
DCC-218ENST00000584710 PKD2Q13563 968 aa11.48□□□□□ -0.57
DCC-218ENST00000584710 DCAF8L2P0C7V8 631 aa11.43□□□□□ -0.58
DCC-218ENST00000584710 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
DCC-218ENST00000584710 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
DCC-218ENST00000584710 CLEC11AQ9Y240 323 aa11.4□□□□□ -0.58
DCC-218ENST00000584710 PRR29P0C7W0 189 aa11.39□□□□□ -0.59
DCC-218ENST00000584710 TRIM41Q8WV44 630 aa11.35□□□□□ -0.59
DCC-218ENST00000584710 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
DCC-218ENST00000584710 GSE1Q14687 1217 aa11.31□□□□□ -0.6
DCC-218ENST00000584710 PLCB2Q00722 1185 aa11.27□□□□□ -0.61
DCC-218ENST00000584710 CREBZFQ9NS37 354 aa11.26□□□□□ -0.61
DCC-218ENST00000584710 PITPNM1O00562 1244 aa11.24□□□□□ -0.61
DCC-218ENST00000584710 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
DCC-218ENST00000584710 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP11.22□□□□□ -0.61
DCC-218ENST00000584710 NUBP1P53384 320 aa11.22□□□□□ -0.61
DCC-218ENST00000584710 RGL2O15211 777 aa11.21□□□□□ -0.61
DCC-218ENST00000584710 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
DCC-218ENST00000584710 FAM212AQ96EL1 285 aa11.21□□□□□ -0.61
DCC-218ENST00000584710 DCAF8Q5TAQ9 597 aa11.2□□□□□ -0.62
DCC-218ENST00000584710 TAOK2Q9UL54 1235 aa11.18□□□□□ -0.62
DCC-218ENST00000584710 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
DCC-218ENST00000584710 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
DCC-218ENST00000584710 CHGAP10645 457 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms