RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513333.1

EPB41L4A-208, Transcript of erythrocyte membrane protein band 4.1 like 4A, human

TSL 5

Gene EPB41L4A, Length 333 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EPB41L4A-208	ENST00000513333	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		7.3	□□□□□ -1.24
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	6.46	□□□□□ -1.38
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	6.4	□□□□□ -1.38
EPB41L4A-208	ENST00000513333	FOXD1	Q16676	465 aa		6.01	□□□□□ -1.45
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		5.87	□□□□□ -1.47
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ADRA2B	P18089	450 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EPB41L4A-208	ENST00000513333	MSH5	O43196	834 aa		5.61	□□□□□ -1.51
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	5.57	□□□□□ -1.52
EPB41L4A-208	ENST00000513333	KCNA4	P22459	653 aa		5.33	□□□□□ -1.56
EPB41L4A-208	ENST00000513333	POTED	Q86YR6	584 aa		5.33	□□□□□ -1.56
EPB41L4A-208	ENST00000513333	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		5.29	□□□□□ -1.56
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EPB41L4A-208	ENST00000513333	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
EPB41L4A-208	ENST00000513333	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
EPB41L4A-208	ENST00000513333	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		5.15	□□□□□ -1.59
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
EPB41L4A-208	ENST00000513333	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
EPB41L4A-208	ENST00000513333	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		5.03	□□□□□ -1.6
EPB41L4A-208	ENST00000513333	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
EPB41L4A-208	ENST00000513333	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ZBTB22	O15209	634 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-208	ENST00000513333	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EPB41L4A-208	ENST00000513333	RNF39	Q9H2S5	420 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EPB41L4A-208	ENST00000513333	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EPB41L4A-208	ENST00000513333	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
EPB41L4A-208	ENST00000513333	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	4.69	□□□□□ -1.66
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SLC4A2	P04920	1241 aa		4.68	□□□□□ -1.66
EPB41L4A-208	ENST00000513333	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
EPB41L4A-208	ENST00000513333		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EPB41L4A-208	ENST00000513333	FKBP8	Q14318	412 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EPB41L4A-208	ENST00000513333	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EPB41L4A-208	ENST00000513333	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EPB41L4A-208	ENST00000513333	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EPB41L4A-208	ENST00000513333	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
EPB41L4A-208	ENST00000513333	APLP2	Q06481	763 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
EPB41L4A-208	ENST00000513333	DSG3	P32926	999 aa		4.51	□□□□□ -1.69
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SLC24A1	O60721	1099 aa		4.49	□□□□□ -1.69
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CAPN15	O75808	1086 aa		4.47	□□□□□ -1.69
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	4.47	□□□□□ -1.69
EPB41L4A-208	ENST00000513333	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		4.37	□□□□□ -1.71
EPB41L4A-208	ENST00000513333	FBLN2	P98095	1184 aa		4.37	□□□□□ -1.71
EPB41L4A-208	ENST00000513333	POLA2	Q14181	598 aa		4.37	□□□□□ -1.71
EPB41L4A-208	ENST00000513333	FBXO3	Q9UK99	471 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ABCB7	O75027	752 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EPB41L4A-208	ENST00000513333	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		4.32	□□□□□ -1.72
EPB41L4A-208	ENST00000513333	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	4.31	□□□□□ -1.72
EPB41L4A-208	ENST00000513333	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	4.3	□□□□□ -1.72
EPB41L4A-208	ENST00000513333	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	4.29	□□□□□ -1.72
EPB41L4A-208	ENST00000513333	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
EPB41L4A-208	ENST00000513333	KLHL34	Q8N239	644 aa		4.23	□□□□□ -1.73
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PROM2	Q8N271	834 aa		4.23	□□□□□ -1.73
EPB41L4A-208	ENST00000513333	AKT1S1	Q96B36	256 aa		4.23	□□□□□ -1.73
EPB41L4A-208	ENST00000513333	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SPDYE6	P0CI01	402 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PLCB2	Q00722	1185 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		4.19	□□□□□ -1.74
EPB41L4A-208	ENST00000513333	POTEH	Q6S545	545 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EPB41L4A-208	ENST00000513333	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		4.18	□□□□□ -1.74
EPB41L4A-208	ENST00000513333	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SPOCK2	Q92563	424 aa		4.17	□□□□□ -1.74
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PKD2	Q13563	968 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	4.15	□□□□□ -1.75
EPB41L4A-208	ENST00000513333	MIER1	Q8N108	512 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EPB41L4A-208	ENST00000513333	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		4.15	□□□□□ -1.75
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PLEKHG5	O94827	1062 aa		4.14	□□□□□ -1.75
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
EPB41L4A-208	ENST00000513333	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	4.11	□□□□□ -1.75
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CFAP44	Q96MT7	982 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
EPB41L4A-208	ENST00000513333	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
EPB41L4A-208	ENST00000513333	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PITPNM1	O00562	1244 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
EPB41L4A-208	ENST00000513333	RGL2	O15211	777 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EPB41L4A-208	ENST00000513333	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EPB41L4A-208	ENST00000513333	BCAN	Q96GW7	911 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
EPB41L4A-208	ENST00000513333	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		4.06	□□□□□ -1.76
EPB41L4A-208	ENST00000513333	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	4.05	□□□□□ -1.76
EPB41L4A-208	ENST00000513333	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		4.04	□□□□□ -1.76
EPB41L4A-208	ENST00000513333	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		4.02	□□□□□ -1.77

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