RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488663.1

ZBTB20-218, Transcript of zinc finger and BTB domain containing 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ZBTB20, Length 1,495 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB20-218ENST00000488663 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
ZBTB20-218ENST00000488663 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.88■■■□□ 2.05
ZBTB20-218ENST00000488663 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
ZBTB20-218ENST00000488663 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
ZBTB20-218ENST00000488663 FOXD1Q16676 465 aa22.92■■□□□ 1.26
ZBTB20-218ENST00000488663 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.44■■□□□ 1.18
ZBTB20-218ENST00000488663 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.77■■□□□ 1.07
ZBTB20-218ENST00000488663 ADRA2BP18089 450 aa21.7■■□□□ 1.06
ZBTB20-218ENST00000488663 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
ZBTB20-218ENST00000488663 MSH5O43196 834 aa21.25■□□□□ 0.99
ZBTB20-218ENST00000488663 POTEDQ86YR6 584 aa20.33■□□□□ 0.85
ZBTB20-218ENST00000488663 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
ZBTB20-218ENST00000488663 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
ZBTB20-218ENST00000488663 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa19.74■□□□□ 0.75
ZBTB20-218ENST00000488663 DMRT2Q9Y5R5 561 aa19.6■□□□□ 0.73
ZBTB20-218ENST00000488663 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa19.26■□□□□ 0.67
ZBTB20-218ENST00000488663 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
ZBTB20-218ENST00000488663 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
ZBTB20-218ENST00000488663 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
ZBTB20-218ENST00000488663 KCNA4P22459 653 aa18.86■□□□□ 0.61
ZBTB20-218ENST00000488663 NPM3O75607 178 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
ZBTB20-218ENST00000488663 DCAF8L1A6NGE4 600 aa18.74■□□□□ 0.59
ZBTB20-218ENST00000488663 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.33■□□□□ 0.53
ZBTB20-218ENST00000488663 RNF39Q9H2S5 420 aa18.2■□□□□ 0.5
ZBTB20-218ENST00000488663 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.11■□□□□ 0.49
ZBTB20-218ENST00000488663 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
ZBTB20-218ENST00000488663 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
ZBTB20-218ENST00000488663 SLC4A2P04920 1241 aa17.91■□□□□ 0.46
ZBTB20-218ENST00000488663 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
ZBTB20-218ENST00000488663 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
ZBTB20-218ENST00000488663 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
ZBTB20-218ENST00000488663 FOXD4L1Q9NU39 408 aa17.44■□□□□ 0.38
ZBTB20-218ENST00000488663 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
ZBTB20-218ENST00000488663 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
ZBTB20-218ENST00000488663 ZBTB22O15209 634 aa17.38■□□□□ 0.37
ZBTB20-218ENST00000488663 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
ZBTB20-218ENST00000488663 CAPN15O75808 1086 aa17.35■□□□□ 0.37
ZBTB20-218ENST00000488663 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
ZBTB20-218ENST00000488663 APLP2Q06481 763 aa17.27■□□□□ 0.36
ZBTB20-218ENST00000488663 TRHP20396 242 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
ZBTB20-218ENST00000488663 DSG3P32926 999 aa17.18■□□□□ 0.34
ZBTB20-218ENST00000488663 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
ZBTB20-218ENST00000488663 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
ZBTB20-218ENST00000488663 ABCB7O75027 752 aa17.01■□□□□ 0.31
ZBTB20-218ENST00000488663 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.92■□□□□ 0.3
ZBTB20-218ENST00000488663 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.91■□□□□ 0.3
ZBTB20-218ENST00000488663 ATXN8OSP0DMR3 200 aa16.85■□□□□ 0.29
ZBTB20-218ENST00000488663 POLA2Q14181 598 aa16.82■□□□□ 0.28
ZBTB20-218ENST00000488663 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
ZBTB20-218ENST00000488663 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
ZBTB20-218ENST00000488663 OSCARQ8IYS5 282 aa16.28■□□□□ 0.2
ZBTB20-218ENST00000488663 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
ZBTB20-218ENST00000488663 FBLN2P98095 1184 aa16.24■□□□□ 0.19
ZBTB20-218ENST00000488663 AKT1S1Q96B36 256 aa16.06■□□□□ 0.16
ZBTB20-218ENST00000488663 SPDYE2BA6NHP3 402 aa16.01■□□□□ 0.15
ZBTB20-218ENST00000488663 SPDYE6P0CI01 402 aa16.01■□□□□ 0.15
ZBTB20-218ENST00000488663 SPDYE2Q495Y8 402 aa16.01■□□□□ 0.15
ZBTB20-218ENST00000488663 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ZBTB20-218ENST00000488663 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
ZBTB20-218ENST00000488663 SSUH2Q9Y2M2 353 aa15.87■□□□□ 0.13
ZBTB20-218ENST00000488663 CHRDL2Q6WN34 429 aa15.84■□□□□ 0.13
ZBTB20-218ENST00000488663 POTEHQ6S545 545 aa15.82■□□□□ 0.12
ZBTB20-218ENST00000488663 PITPNM1O00562 1244 aa15.77■□□□□ 0.11
ZBTB20-218ENST00000488663 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP15.68■□□□□ 0.1
ZBTB20-218ENST00000488663 SPDYE4A6NLX3 237 aa15.65■□□□□ 0.1
ZBTB20-218ENST00000488663 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
ZBTB20-218ENST00000488663 CLEC11AQ9Y240 323 aa15.59■□□□□ 0.09
ZBTB20-218ENST00000488663 PIP4P2Q8N4L2 257 aa15.58■□□□□ 0.08
ZBTB20-218ENST00000488663 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP15.54■□□□□ 0.08
ZBTB20-218ENST00000488663 PRR29P0C7W0 189 aa15.39■□□□□ 0.05
ZBTB20-218ENST00000488663 PROM2Q8N271 834 aa15.37■□□□□ 0.05
ZBTB20-218ENST00000488663 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
ZBTB20-218ENST00000488663 FKBP8Q14318 412 aa15.3■□□□□ 0.04
ZBTB20-218ENST00000488663 STAG3Q9UJ98 1225 aa15.29■□□□□ 0.04
ZBTB20-218ENST00000488663 CHADLQ6NUI6 762 aa15.28■□□□□ 0.04
ZBTB20-218ENST00000488663 HAX1O00165 279 aa15.14■□□□□ 0.01
ZBTB20-218ENST00000488663 CREBZFQ9NS37 354 aa15.14■□□□□ 0.01
ZBTB20-218ENST00000488663 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0.01
ZBTB20-218ENST00000488663 EVX2Q03828 476 aa15.05■□□□□ -0
ZBTB20-218ENST00000488663 C19orf67A6NJJ6 358 aa15.02■□□□□ -0
ZBTB20-218ENST00000488663 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
ZBTB20-218ENST00000488663 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ZBTB20-218ENST00000488663 CD44P16070 742 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ZBTB20-218ENST00000488663 MIER1Q8N108 512 aa14.87□□□□□ -0.03
ZBTB20-218ENST00000488663 FBXO3Q9UK99 471 aa14.82□□□□□ -0.04
ZBTB20-218ENST00000488663 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP14.81□□□□□ -0.04
ZBTB20-218ENST00000488663 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.79□□□□□ -0.04
ZBTB20-218ENST00000488663 PLEKHG5O94827 1062 aa14.78□□□□□ -0.04
ZBTB20-218ENST00000488663 ZRANB1Q9UGI0 708 aa14.74□□□□□ -0.05
ZBTB20-218ENST00000488663 GABBR2O75899 941 aa14.69□□□□□ -0.06
ZBTB20-218ENST00000488663 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ZBTB20-218ENST00000488663 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ZBTB20-218ENST00000488663 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ZBTB20-218ENST00000488663 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ZBTB20-218ENST00000488663 RASEFQ8IZ41 740 aa14.61□□□□□ -0.07
ZBTB20-218ENST00000488663 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ZBTB20-218ENST00000488663 PHF12Q96QT6 1004 aa14.59□□□□□ -0.07
ZBTB20-218ENST00000488663 NUBP1P53384 320 aa14.57□□□□□ -0.08
ZBTB20-218ENST00000488663 CLCN6P51797 869 aa14.56□□□□□ -0.08
ZBTB20-218ENST00000488663 CCDC61Q9Y6R9 512 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 855 ms