RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428176.1

CHRM3-AS2-202, CHRM3 antisense RNA 2, humanhuman

TSL 5

Gene CHRM3-AS2, Length 789 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.54■■■□□ 2
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 FOXD1Q16676 465 aa23.38■■□□□ 1.33
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 POTEDQ86YR6 584 aa21.95■■□□□ 1.1
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 MSH5O43196 834 aa21.94■■□□□ 1.1
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.83■■□□□ 1.09
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.66■■□□□ 1.06
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 ADRA2BP18089 450 aa21.54■■□□□ 1.04
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 DMRT2Q9Y5R5 561 aa19.8■□□□□ 0.76
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa19.12■□□□□ 0.65
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 DCAF8L1A6NGE4 600 aa18.93■□□□□ 0.62
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa18.82■□□□□ 0.6
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 RNF39Q9H2S5 420 aa18.73■□□□□ 0.59
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 KCNA4P22459 653 aa18.59■□□□□ 0.57
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.37■□□□□ 0.53
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 NPM3O75607 178 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.01■□□□□ 0.47
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 DSG3P32926 999 aa17.44■□□□□ 0.38
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 CAPN15O75808 1086 aa17.42■□□□□ 0.38
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 SLC4A2P04920 1241 aa17.34■□□□□ 0.37
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.21■□□□□ 0.35
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 ZBTB22O15209 634 aa17.16■□□□□ 0.34
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 POTEHQ6S545 545 aa17.12■□□□□ 0.33
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 TRHP20396 242 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.06■□□□□ 0.32
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 FOXD4L1Q9NU39 408 aa17.06■□□□□ 0.32
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 APLP2Q06481 763 aa17.04■□□□□ 0.32
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 ABCB7O75027 752 aa17.01■□□□□ 0.31
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 POLA2Q14181 598 aa16.57■□□□□ 0.24
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 ATXN8OSP0DMR3 200 aa16.47■□□□□ 0.23
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 CHRDL2Q6WN34 429 aa16.37■□□□□ 0.21
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 AKT1S1Q96B36 256 aa16.18■□□□□ 0.18
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 OSCARQ8IYS5 282 aa16.05■□□□□ 0.16
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 PIP4P2Q8N4L2 257 aa15.94■□□□□ 0.14
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 PITPNM1O00562 1244 aa15.87■□□□□ 0.13
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP15.81■□□□□ 0.12
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 SPDYE2BA6NHP3 402 aa15.68■□□□□ 0.1
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 HAX1O00165 279 aa15.68■□□□□ 0.1
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 SPDYE6P0CI01 402 aa15.68■□□□□ 0.1
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 SPDYE2Q495Y8 402 aa15.68■□□□□ 0.1
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 FBLN2P98095 1184 aa15.65■□□□□ 0.1
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 EVX2Q03828 476 aa15.56■□□□□ 0.08
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 SSUH2Q9Y2M2 353 aa15.47■□□□□ 0.07
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 CLEC11AQ9Y240 323 aa15.44■□□□□ 0.06
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 FKBP8Q14318 412 aa15.36■□□□□ 0.05
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 C19orf67A6NJJ6 358 aa15.31■□□□□ 0.04
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 SPDYE4A6NLX3 237 aa15.31■□□□□ 0.04
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 CHADLQ6NUI6 762 aa15.22■□□□□ 0.03
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP15.21■□□□□ 0.03
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 GABBR2O75899 941 aa15.15■□□□□ 0.02
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 PRR29P0C7W0 189 aa15.15■□□□□ 0.02
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 PROM2Q8N271 834 aa15.13■□□□□ 0.01
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 CD44P16070 742 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 LHX8Q68G74 356 aa14.92□□□□□ -0.02
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 POTEIP0CG38 1075 aa14.87□□□□□ -0.03
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 CLCN6P51797 869 aa14.77□□□□□ -0.05
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 FBXO3Q9UK99 471 aa14.77□□□□□ -0.05
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 CREBZFQ9NS37 354 aa14.76□□□□□ -0.05
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.76□□□□□ -0.05
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 ZRANB1Q9UGI0 708 aa14.67□□□□□ -0.06
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 DCBLD2Q96PD2 775 aa14.62□□□□□ -0.07
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 MIER1Q8N108 512 aa14.5□□□□□ -0.09
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 PHF12Q96QT6 1004 aa14.47□□□□□ -0.09
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.46□□□□□ -0.09
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP14.42□□□□□ -0.1
CHRM3-AS2-202ENST00000428176 POTEB2H3BUK9 544 aa14.38□□□□□ -0.11
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