RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000217270.1

Ccdc84-211, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc84, Length 681 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa44,57■■■■■ 4,72
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 NischQ80TM9 1593 aa43,69■■■■■ 4,58
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Abcc8B2RUS7 1588 aa42,35■■■■■ 4,37
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Abcc9P70170 1546 aa42,29■■■■■ 4,36
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 ScribQ80U72 1612 aa41,16■■■■■ 4,18
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 NacadQ5SWP3 1504 aa39,67■■■■□ 3,94
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Kdm5dQ62240 1548 aa39,64■■■■□ 3,94
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Sycp2Q9CUU3 1500 aa38,94■■■■□ 3,82
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Dcaf1Q80TR8 1506 aa38,91■■■■□ 3,82
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 BicraF8VPZ9 1578 aa38,53■■■■□ 3,76
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa38,09■■■■□ 3,69
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa37,86■■■■□ 3,65
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Ccdc180J3QNE4 1664 aa37,53■■■■□ 3,6
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Baz1aO88379 1555 aa37,51■■■■□ 3,59
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP37,39■■■■□ 3,58
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP37,36■■■■□ 3,57
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Crybg2B7ZCC2 1516 aa37,36■■■■□ 3,57
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Rhox8Q6VSS7 320 aa37,2■■■■□ 3,55
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP36,99■■■■□ 3,51
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP36,94■■■■□ 3,5
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa36,71■■■■□ 3,47
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP36,61■■■■□ 3,45
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Ercc6F8VPZ5 1481 aa36,61■■■■□ 3,45
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Smarca2Q6DIC0 1577 aa36,59■■■■□ 3,45
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa36,47■■■■□ 3,43
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Fam135aQ6NS59 1506 aa36,4■■■■□ 3,42
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa36,38■■■■□ 3,41
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Wdr62Q3U3T8 1523 aa36,23■■■■□ 3,39
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Frmpd1A2AKB4 1549 aa36,13■■■■□ 3,38
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP35,93■■■■□ 3,34
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Baz1bQ9Z277 1479 aa35,9■■■■□ 3,34
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Unc13aQ4KUS2 1712 aa35,82■■■■□ 3,32
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Rtl1Q7M732 1744 aa35,62■■■■□ 3,29
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Ubl4bQ9CQ84 188 aa35,55■■■■□ 3,28
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa35,52■■■■□ 3,28
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Mrc2Q64449 1479 aa35,48■■■■□ 3,27
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 CftrP26361 1476 aa35,47■■■■□ 3,27
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Synj1Q8CHC4 1574 aa35,42■■■■□ 3,26
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP35,21■■■■□ 3,23
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa34,9■■■■□ 3,18
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa34,85■■■■□ 3,17
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Cux2P70298 1426 aa34,72■■■■□ 3,15
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Kif21aQ9QXL2 1672 aa34,69■■■■□ 3,14
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP34,68■■■■□ 3,14
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP34,65■■■■□ 3,14
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Kif15Q6P9L6 1387 aa34,64■■■■□ 3,14
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Dnajc5P60904 198 aa34,57■■■■□ 3,12
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Trim41Q5NCC3 630 aa34,57■■■■□ 3,12
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Lamc3Q9R0B6 1581 aa34,57■■■■□ 3,12
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP34,32■■■■□ 3,09
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP34,23■■■■□ 3,07
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Cep164Q5DU05 1446 aa34,17■■■■□ 3,06
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 TnnQ80Z71 1560 aa34,12■■■■□ 3,05
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP34,05■■■■□ 3,04
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Shroom2A2ALU4 1481 aa34,03■■■■□ 3,04
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Top2bQ64511 1612 aa34,03■■■■□ 3,04
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP33,97■■■■□ 3,03
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Plb1Q3TTY0 1478 aa33,95■■■■□ 3,02
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Ccdc18Q640L5 1455 aa33,95■■■■□ 3,02
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Camsap1A2AHC3 1581 aa33,92■■■■□ 3,02
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Crocc2F6XLV1 1638 aa33,9■■■■□ 3,02
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Golga3P55937 1487 aa33,88■■■■□ 3,01
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP33,84■■■■□ 3,01
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Il27Q8K3I6 234 aa33,81■■■■□ 3
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Rusc2Q80U22 1514 aa33,65■■■□□ 2,98
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP33,64■■■□□ 2,98
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Cngb1E1AZ71 1325 aa33,63■■■□□ 2,97
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Ift140E9PY46 1464 aa33,63■■■□□ 2,97
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Col17a1Q07563 1470 aa33,62■■■□□ 2,97
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Fmn1Q05860 1466 aa33,59■■■□□ 2,97
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP33,49■■■□□ 2,95
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Duox2A2AQ99 1517 aa33,48■■■□□ 2,95
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Setd1bQ8CFT2 1985 aa33,41■■■□□ 2,94
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Grin2bQ01097 1482 aa33,37■■■□□ 2,93
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Disp1Q3TDN0 1521 aa33,35■■■□□ 2,93
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Samd9lQ69Z37 1561 aa33,31■■■□□ 2,92
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP33,31■■■□□ 2,92
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP33,24■■■□□ 2,91
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP33,24■■■□□ 2,91
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP33,22■■■□□ 2,91
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa33,14■■■□□ 2,9
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Efcab5A0JP43 1406 aa33,11■■■□□ 2,89
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Rad54l2Q99NG0 1466 aa33■■■□□ 2,87
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Magi3Q9EQJ9 1476 aa32,98■■■□□ 2,87
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Grin2aP35436 1464 aa32,97■■■□□ 2,87
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP32,94■■■□□ 2,86
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP32,92■■■□□ 2,86
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa32,92■■■□□ 2,86
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 NrkQ9R0G8 1455 aa32,89■■■□□ 2,86
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Gpatch8A2A6A1 1505 aa32,84■■■□□ 2,85
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Fgd6Q69ZL1 1399 aa32,83■■■□□ 2,85
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Adgrl3Q80TS3 1537 aa32,81■■■□□ 2,84
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Cep170Q6A065 1588 aa32,8■■■□□ 2,84
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 PtprkP35822 1457 aa32,74■■■□□ 2,83
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Pla2r1Q62028 1487 aa32,74■■■□□ 2,83
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Shroom4Q1W617 1475 aa32,74■■■□□ 2,83
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa32,73■■■□□ 2,83
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 SynmQ70IV5 1561 aa32,72■■■□□ 2,83
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa32,71■■■□□ 2,83
Ccdc84-211ENSMUST00000217270 Abcc1O35379 1528 aa32,62■■■□□ 2,81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 44,2 ms