RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000204274.1

6820426E19Rik-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene 6820426E19Rik, Length 1,970 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa24.81■■□□□ 1.56
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 NischQ80TM9 1593 aa24.69■■□□□ 1.54
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Abcc9P70170 1546 aa23.99■■□□□ 1.43
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Abcc8B2RUS7 1588 aa23.72■■□□□ 1.39
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 ScribQ80U72 1612 aa22.55■■□□□ 1.2
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Dcaf1Q80TR8 1506 aa22.01■■□□□ 1.11
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Kdm5dQ62240 1548 aa21.91■■□□□ 1.1
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 NacadQ5SWP3 1504 aa21.86■■□□□ 1.09
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Rhox8Q6VSS7 320 aa21.81■■□□□ 1.08
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa21.58■■□□□ 1.04
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Ccdc180J3QNE4 1664 aa21.43■■□□□ 1.02
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Sycp2Q9CUU3 1500 aa21.42■■□□□ 1.02
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Baz1aO88379 1555 aa21.32■■□□□ 1
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Crybg2B7ZCC2 1516 aa21.14■□□□□ 0.97
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 BicraF8VPZ9 1578 aa21.05■□□□□ 0.96
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Rtl1Q7M732 1744 aa20.99■□□□□ 0.95
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Smarca2Q6DIC0 1577 aa20.77■□□□□ 0.92
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa20.44■□□□□ 0.86
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa20.39■□□□□ 0.85
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa20.34■□□□□ 0.85
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa20.12■□□□□ 0.81
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Synj1Q8CHC4 1574 aa20.12■□□□□ 0.81
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 CftrP26361 1476 aa20.08■□□□□ 0.8
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa20.06■□□□□ 0.8
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Trim41Q5NCC3 630 aa20.04■□□□□ 0.8
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Ercc6F8VPZ5 1481 aa19.87■□□□□ 0.77
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Wdr62Q3U3T8 1523 aa19.86■□□□□ 0.77
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Frmpd1A2AKB4 1549 aa19.82■□□□□ 0.76
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Golga3P55937 1487 aa19.69■□□□□ 0.74
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Unc13aQ4KUS2 1712 aa19.64■□□□□ 0.74
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Top2bQ64511 1612 aa19.64■□□□□ 0.74
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa19.63■□□□□ 0.73
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Fam135aQ6NS59 1506 aa19.6■□□□□ 0.73
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa19.53■□□□□ 0.72
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Cngb1E1AZ71 1325 aa19.53■□□□□ 0.72
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 HrcG5E8J6 738 aa19.46■□□□□ 0.71
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Lamc3Q9R0B6 1581 aa19.37■□□□□ 0.69
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 TnnQ80Z71 1560 aa19.36■□□□□ 0.69
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Chic1Q8CBW7 227 aa19.35■□□□□ 0.69
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Fmn1Q05860 1466 aa19.35■□□□□ 0.69
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Baz1bQ9Z277 1479 aa19.35■□□□□ 0.69
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa19.33■□□□□ 0.69
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Ubl4bQ9CQ84 188 aa19.29■□□□□ 0.68
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Kif15Q6P9L6 1387 aa19.27■□□□□ 0.68
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Cep164Q5DU05 1446 aa19.22■□□□□ 0.67
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Cux2P70298 1426 aa19.13■□□□□ 0.65
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Mrc2Q64449 1479 aa19.11■□□□□ 0.65
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Camsap1A2AHC3 1581 aa19.1■□□□□ 0.65
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Ccdc18Q640L5 1455 aa19.03■□□□□ 0.64
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Il27Q8K3I6 234 aa18.91■□□□□ 0.62
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Kif21aQ9QXL2 1672 aa18.9■□□□□ 0.62
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Grin2bQ01097 1482 aa18.88■□□□□ 0.61
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Gab3Q8BSM5 595 aa18.82■□□□□ 0.6
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 NrkQ9R0G8 1455 aa18.82■□□□□ 0.6
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa18.78■□□□□ 0.6
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Shroom4Q1W617 1475 aa18.76■□□□□ 0.59
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 PtprkP35822 1457 aa18.76■□□□□ 0.59
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Duox2A2AQ99 1517 aa18.73■□□□□ 0.59
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Crocc2F6XLV1 1638 aa18.73■□□□□ 0.59
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Efcab5A0JP43 1406 aa18.7■□□□□ 0.58
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa18.69■□□□□ 0.58
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Samd9lQ69Z37 1561 aa18.63■□□□□ 0.57
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Cep162Q6ZQ06 1403 aa18.62■□□□□ 0.57
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Plb1Q3TTY0 1478 aa18.6■□□□□ 0.57
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Npm2Q80W85 207 aa18.6■□□□□ 0.57
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Arhgap35Q91YM2 1499 aa18.57■□□□□ 0.56
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa18.53■□□□□ 0.56
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Map3k1P53349 1493 aa18.53■□□□□ 0.56
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 SynmQ70IV5 1561 aa18.49■□□□□ 0.55
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Ift140E9PY46 1464 aa18.48■□□□□ 0.55
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Rad54l2Q99NG0 1466 aa18.45■□□□□ 0.54
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Disp1Q3TDN0 1521 aa18.45■□□□□ 0.54
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Magi3Q9EQJ9 1476 aa18.42■□□□□ 0.54
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Setd1bQ8CFT2 1985 aa18.41■□□□□ 0.54
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Zeb1Q64318 1117 aa18.41■□□□□ 0.54
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Grin2aP35436 1464 aa18.38■□□□□ 0.53
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Gpatch8A2A6A1 1505 aa18.37■□□□□ 0.53
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Pla2r1Q62028 1487 aa18.37■□□□□ 0.53
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Myt1lP97500 1187 aa18.37■□□□□ 0.53
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 Carmil1Q6EDY6 1374 aa18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 44.4 ms