RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637524.1

U6.99-201, humanhuman

BASIC

Gene U6, Length 83 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U6.99-201ENST00000637524 ZNF549Q6P9A3 640 aa2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 NHLRC1Q6VVB1 395 aa2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 NUP54Q7Z3B4 507 aa2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 HOOK3Q86VS8 718 aa2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 LONP2Q86WA8 852 aa2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 ZNF575Q86XF7 245 aa2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 SFR1Q86XK3 245 aa2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 ODF3L1Q8IXM7 274 aa2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 CARNMT1Q8N4J0 409 aa2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 BMPERQ8N8U9 685 aa2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 AMER3Q8N944 861 aa2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 NPEPL1Q8NDH3 523 aa2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 FGFBP3Q8TAT2 258 aa2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 HEXDCQ8WVB3 486 aa2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 TMED6Q8WW62 240 aa2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 TEKT1Q969V4 418 aa2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 CENPTQ96BT3 561 aa2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 RTP4Q96DX8 246 aa2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 SCRN2Q96FV2 425 aa2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 ADGRG7Q96K78 797 aa2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 DUX5Q96PT3 197 aa2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 TMEM204Q9BSN7 226 aa2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 SLC29A3Q9BZD2 475 aa2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 DBNDD1Q9H9R9 158 aa2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 CD93Q9NPY3 652 aa2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 TXNDC16Q9P2K2 825 aa2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 POU2F3Q9UKI9 436 aa2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 KCNK7Q9Y2U2 307 aa2.73□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 TRIM64A6NGJ6 449 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 TRIM64BA6NI03 449 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 E9PI62 339 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 FAM86B1E9PN63 330 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 FCGR3BO75015 233 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 SLC22A3O75751 556 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 ATP6AP2O75787 350 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 BAG4O95429 457 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 PNPP00491 289 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 IGHV4-39P01824 125 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 RLN1P04808 185 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 FAM86B2P0C5J1 330 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 CDH1P12830 882 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 GP1BBP13224 206 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 IRF2P14316 349 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 HLA-DPA1P20036 260 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 IL15P40933 162 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 PRKCIP41743 596 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 PSMC4P43686 418 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 IER3P46695 156 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 UBASH3AP57075 661 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 PTENP60484 403 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 ST8SIA6P61647 398 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 RPS18P62269 152 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 CX3CL1P78423 397 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 KLC1Q07866 573 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 ZBTB17Q13105 803 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 CKAP5Q14008 2032 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 CCDC6Q16204 474 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 PTGISQ16647 500 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 CA9Q16790 459 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 UGT3A2Q3SY77 523 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 LRRC73Q5JTD7 316 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 TCTE1Q5JU00 501 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 CYP4A22Q5TCH4 519 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 CREB3L2Q70SY1 520 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 TUBA1AQ71U36 451 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 NRARPQ7Z6K4 114 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 EXOC3L1Q86VI1 746 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 KLHL7Q8IXQ5 586 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 SYCP3Q8IZU3 236 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 NDUFAF2Q8N183 169 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 ARHGAP24Q8N264 748 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 THAP8Q8NA92 274 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 SPC24Q8NBT2 197 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 SMRP1Q8NCR6 262 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 ZFAND2BQ8WV99 257 aa2.72□□□□□ -1.97
U6.99-201ENST00000637524 IRGQQ8WZA9 623 aa2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms