RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 EPORP19235 508 aa24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 INHBCP55103 352 aa24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 GRB7Q14451 532 aa24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM219BQ5XKK7 198 aa24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 OR56A3Q8NH54 315 aa24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP6V1E2Q96A05 226 aa24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHDC7BQ96G42 594 aa24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 NTMT1Q9BV86 223 aa24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 MEAF6Q9HAF1 191 aa24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 DCXO43602 365 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 UROSP10746 265 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 BCKDHBP21953 392 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 CCNG1P51959 295 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 CTBSQ01459 385 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 LETMD1Q6P1Q0 360 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4F6Q8NGB9 312 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF480Q8WV37 535 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 CDK15Q96Q40 435 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 OR52B2Q96RD2 323 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM168Q9H0V1 697 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 MYLK2Q9H1R3 596 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJC11Q9NVH1 559 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC22A14Q9Y267 594 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 SDHDO14521 159 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 NAE1Q13564 534 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 FZD2Q14332 565 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 CLCA4Q14CN2 919 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 UAP1L1Q3KQV9 507 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 HID1Q8IV36 788 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 TBC1D21Q8IYX1 336 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 TWIST2Q8WVJ9 160 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP1R36Q96LQ0 422 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 C12orf66Q96MD2 445 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC28BQ9BUN5 200 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 TCF7L2Q9NQB0 619 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA8OA6NCC3 632 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA8NF8WBI6 632 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 CRCPO75575 148 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 RASGRP1O95267 797 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 TNFP01375 233 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 ITPKAP23677 461 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 EPHA3P29320 983 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 TSSK4Q6SA08 328 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 WASH2PQ6VEQ5 465 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 MILR1Q7Z6M3 343 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 MFSD2AQ8NA29 543 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 ERP27Q96DN0 273 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 HSPA12BQ96MM6 686 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 WASH6PQ9NQA3 447 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 PRDM8Q9NQV8 689 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFP69BQ9UJL9 534 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 TIMM22Q9Y584 194 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 CEP192Q8TEP8 1941 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PR77 199 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 PDZK1P1A8MUH7 402 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 MEI4A8MW99 385 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 FCHO1O14526 889 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 MAP3K13O43283 966 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 SERPINA6P08185 405 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 EBLN1P0CF75 366 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 TDGF1P13385 188 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 AK4P27144 223 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 CD38P28907 300 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 RACK1P63244 317 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 CDC16Q13042 620 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 TJAP1Q5JTD0 557 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 METTL21CQ5VZV1 264 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 ACAD11Q709F0 780 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 CLNKQ7Z7G1 428 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 CDYL2Q8N8U2 506 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 SNX31Q8N9S9 440 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 PPFIBP2Q8ND30 876 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 CCL4L1Q8NHW4 92 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 NMUR2Q9GZQ4 415 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 TUBB1Q9H4B7 451 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 TBC1D29Q9UFV1 150 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC22O60826 627 aa24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms