RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623449.3

CU633967.1-202, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CU633967.1, Length 560 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633967.1-202ENST00000623449 CEACAM4O75871 244 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 NTRK1P04629 796 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 CAPN1P07384 714 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 CD63P08962 238 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 TPBGLP0DKB5 382 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 AOAHP28039 575 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 ATP5DP30049 168 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 PKLRP30613 574 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 CCR7P32248 378 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 GRIA1P42261 906 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 NPY2RP49146 381 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 LMAN1P49257 510 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 RAB28P51157 221 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 ITGA1P56199 1179 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 PRAMEP78395 509 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 CCZ1BP86790 482 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 ERV3-1Q14264 604 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 KYNUQ16719 465 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 SYTL3Q4VX76 610 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 NUP210LQ5VU65 1888 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 RHBDD2Q6NTF9 364 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 LRRC8BQ6P9F7 803 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 FAM198BQ6UWH4 519 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 UNC5AQ6ZN44 842 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 HPS6Q86YV9 775 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 NAV2Q8IVL1 2488 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 LRRC8AQ8IWT6 810 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 OR1L3Q8NH93 324 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 PROKR1Q8TCW9 393 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 SLC22A18Q96BI1 424 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 P2RY12Q9H244 342 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 CATSPERZQ9NTU4 200 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 PCMTD2Q9NV79 361 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 BFARQ9NZS9 450 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 FAM8A1Q9UBU6 413 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 SRPK3Q9UPE1 567 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 MRFAP1Q9Y605 127 aa8.5□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 CCDC78A2IDD5 438 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 E7EQ34 232 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 H3BMM5 538 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 NRDCO43847 1150 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 KATNA1O75449 491 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 ONECUT2O95948 504 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 S1PR4O95977 384 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 FGGP02679 453 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 APOA4P06727 396 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 ETS1P14921 441 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 UGT2B7P16662 529 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 CYP2A7P20853 494 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 ARNTP27540 789 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 CD97P48960 835 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 TLE1Q04724 770 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 KLRB1Q12918 225 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 IL10RAQ13651 578 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 GBX1Q14549 363 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 SEMA3AQ14563 771 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 NCF4Q15080 339 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 TMED2Q15363 201 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 TYSND1Q2T9J0 566 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 C16orf46Q6P387 395 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 TLDC1Q6P9B6 456 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 SYTL1Q8IYJ3 562 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 RASGEF1CQ8N431 466 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 PHC3Q8NDX5 983 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 OR6P1Q8NGX9 317 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 HMGCLL1Q8TB92 370 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 NACC2Q96BF6 587 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 IP6K3Q96PC2 410 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 PANX3Q96QZ0 392 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 TCF12Q99081 682 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 EPN3Q9H201 632 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 CHST8Q9H2A9 424 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 CHRAC1Q9NRG0 131 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 GNPTGQ9UJJ9 305 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 TCFL5Q9UL49 500 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 SOX13Q9UN79 622 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa8.49□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa8.48□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 CDC14CA4D256 554 aa8.48□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 CLEC18AA5D8T8 446 aa8.48□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa8.48□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 MLNP12872 115 aa8.48□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 OGNP20774 298 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CU633967.1-202ENST00000623449 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms