RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597474.5

FCHO1-220, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 556 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-220ENST00000597474 SLC6A20Q9NP91 592 aa12.51□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 PLAGL1Q9UM63 463 aa12.51□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 PRSS21Q9Y6M0 314 aa12.51□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa12.51□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 POLQO75417 2590 aa12.5□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 A0A0J9YY10 115 aa12.5□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 AGPSO00116 658 aa12.5□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 E2F3O00716 465 aa12.5□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 KCNN4O15554 427 aa12.5□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 IPO13O94829 963 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 IGHEP01854 428 aa12.5□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 TNFRSF8P28908 595 aa12.5□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 SHMT2P34897 504 aa12.5□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 GCGRP47871 477 aa12.5□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 BRD3Q15059 726 aa12.5□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 CYP2A13Q16696 494 aa12.5□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa12.5□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 TAS2R42Q7RTR8 314 aa12.5□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 KCNMB4Q86W47 210 aa12.5□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 VSTM4Q8IW00 320 aa12.5□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa12.5□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 DNAJC22Q8N4W6 341 aa12.5□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa12.5□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 TM9SF4Q92544 642 aa12.5□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 ANP32EQ9BTT0 268 aa12.5□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 ARNT2Q9HBZ2 717 aa12.5□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa12.5□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 TXLNGQ9NUQ3 528 aa12.5□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 FBXL4Q9UKA2 621 aa12.5□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 ASF1AQ9Y294 204 aa12.5□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa12.49□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 MACROD2A1Z1Q3 448 aa12.49□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 H7C0S8 307 aa12.49□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 PJA2O43164 708 aa12.49□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 RBP3P10745 1247 aa12.49□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 PRF1P14222 555 aa12.49□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 TPH1P17752 444 aa12.49□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 ITGA3P26006 1051 aa12.49□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 PRPSAP1Q14558 356 aa12.49□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 CCDC181Q5TID7 509 aa12.49□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 TLDC1Q6P9B6 456 aa12.49□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 ZNF449Q6P9G9 518 aa12.49□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa12.49□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP12.49□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 SPATA13Q96N96 652 aa12.49□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 IRAK4Q9NWZ3 460 aa12.49□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa12.49□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 OR6C2Q9NZP2 312 aa12.49□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 KLHL20Q9Y2M5 609 aa12.49□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 PCNX1Q96RV3 2341 aa12.49□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 SLC5A10A0PJK1 596 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 CCDC78A2IDD5 438 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 OR51F1A6NGY5 319 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 ISM1B1AKI9 464 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 SOCS6O14544 535 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 LRRTM2O43300 516 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 KLHL41O60662 606 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 AP2A2O94973 939 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 CD63P08962 238 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 GSTM1P09488 218 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 MAGP20916 626 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 MMP11P24347 488 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 GSTM4Q03013 218 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 CACNG1Q06432 222 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 KCTD11Q693B1 232 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 C11orf63Q6NUN7 778 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 AADACL2Q6P093 401 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 IGFL2Q6UWQ7 119 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 COX15Q7KZN9 410 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 TBC1D21Q8IYX1 336 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 OR5K2Q8NHB8 316 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 GRHL3Q8TE85 626 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 PPP4R1Q8TF05 950 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 ELMO1Q92556 727 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 SPSB2Q99619 263 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 MESP1Q9BRJ9 268 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 NDC1Q9BTX1 674 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 EURLQ9NYK6 297 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 PLCL2Q9UPR0 1127 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 OSGIN2Q9Y236 505 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa12.48□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 CBFA2T2O43439 604 aa12.47□□□□□ -0.41
FCHO1-220ENST00000597474 TPM1P09493 284 aa12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms