RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 ERV3-1Q14264 604 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CYP1B1Q16678 543 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 DEFB109BQ30KR1 87 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00303Q3SY05 128 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 NEPROQ6NW34 567 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC6Q86X45 466 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 VRK3Q8IV63 474 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SLC22A15Q8IZD6 547 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 MPP5Q8N3R9 675 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF843Q8N446 348 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 OR8K5Q8NH50 307 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 MR1Q95460 341 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 FAM136AQ96C01 138 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CLIP3Q96DZ5 547 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CAPZA3Q96KX2 299 aa8.06□□□□□ -1.12
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PTPRM-214ENST00000583153 SYTL2Q9HCH5 934 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
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PTPRM-214ENST00000583153 ASIC3Q9UHC3 531 aa8.06□□□□□ -1.12
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PTPRM-214ENST00000583153 IL17BQ9UHF5 180 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 KCND3Q9UK17 655 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SLC39A10Q9ULF5 831 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ICKQ9UPZ9 632 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM150CB9EJG8 249 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 E7EQ34 232 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 H3BMM5 538 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CES2O00748 559 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 GPC4O75487 556 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM63AO94886 807 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 UGT2B7P16662 529 aa8.05□□□□□ -1.12
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PTPRM-214ENST00000583153 ARNTP27540 789 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 AOAHP28039 575 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 PAFAH1B1P43034 410 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 MAGEA6P43360 314 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 RPS15P62841 145 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CDC20Q12834 499 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 NFATC3Q12968 1075 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 GPS2Q13227 327 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 DNASE1L3Q13609 305 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa8.05□□□□□ -1.12
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PTPRM-214ENST00000583153 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SPESP1Q6UW49 350 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SYT10Q6XYQ8 523 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM73Q86UV7 250 aa8.05□□□□□ -1.12
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PTPRM-214ENST00000583153 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 KLHL7Q8IXQ5 586 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 PPIL6Q8IXY8 311 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 GPR135Q8IZ08 494 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 RAB42Q8N4Z0 105 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 EXD3Q8N9H8 876 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 MCUQ8NE86 351 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TCTN2Q96GX1 697 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SERPINB12Q96P63 405 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TCF12Q99081 682 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 FAM117AQ9C073 453 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TWSG1Q9GZX9 223 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 P2RY12Q9H244 342 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC68Q9H2F9 335 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 OR6C2Q9NZP2 312 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 BTRCQ9Y297 605 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 MRFAP1Q9Y605 127 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 A0A0J9YY10 115 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CDC14CA4D256 554 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 C21orf140B9A014 251 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 NIPSNAP2O75323 286 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 SLCO2B1O94956 709 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 ESR1P03372 595 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 PKMP14618 531 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 OGNP20774 298 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 CD9P21926 228 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 OAS2P29728 719 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-214ENST00000583153 RAB28P51157 221 aa8.04□□□□□ -1.12
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