RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 FKBP1BP68106 108 aa20.95■□□□□ 0.94
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PTPRM-211ENST00000580170 OR13C4Q8NGS5 318 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 EMC3Q9P0I2 261 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 SLC35G6P0C7Q6 338 aa20.95■□□□□ 0.94
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PTPRM-211ENST00000580170 OR4C6Q8NH72 309 aa20.95■□□□□ 0.94
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PTPRM-211ENST00000580170 ERVW-1Q9UQF0 538 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 GNALP38405 381 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 PLA2G16P53816 162 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
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