RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565324.5

SMG1-211, Transcript of SMG1, nonsense mediated mRNA decay associated PI3K related kinase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMG1, Length 12,465 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1-211ENST00000565324 RASGEF1CQ8N431 466 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 TSSK3Q96PN8 268 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 CCDC106Q9BWC9 280 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 TMEM134Q9H6X4 195 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 PSMD9O00233 223 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 PENKP01210 267 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 IFNA5P01569 189 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 HLA-DPB1P04440 258 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 NELFEP18615 380 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 AQP1P29972 269 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 ARFRP1Q13795 201 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 NPTX1Q15818 432 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 RAB41Q5JT25 222 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 ATAD3CQ5T2N8 411 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 SULT4A1Q9BR01 284 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 PXMP2Q9NR77 195 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 F8VP50 259 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 SCGB1D2O95969 90 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 PSEN2P49810 448 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 NCS1P62166 190 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 BCL2A1Q16548 175 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 CCL15Q16663 113 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 PDZD9Q8IXQ8 264 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 C1orf21Q9H246 121 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 ANKRD33BA6NCL7 494 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 GABBR2O75899 941 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 OAZ2O95190 189 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 ITGB1P05556 798 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 CDK2P24941 298 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 VEGFCP49767 419 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 ACTC1P68032 377 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 ACTA1P68133 377 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 HID1Q8IV36 788 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 AZIN2Q96A70 460 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 ISOC1Q96CN7 298 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 TAPBPLQ9BX59 468 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 KCNQ5Q9NR82 932 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 PACSIN3Q9UKS6 424 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 ALPPP05187 535 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 TUBG1P23258 451 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 CD79BP40259 229 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 CLCN3P51790 818 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 TBRG1Q3YBR2 411 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 ARSHQ5FYA8 562 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 ZNF101Q8IZC7 436 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 ELP5Q8TE02 316 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 EPS8L1Q8TE68 723 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 BTF3L4Q96K17 158 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 DHRS1Q96LJ7 313 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 ELP3Q9H9T3 547 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 PNPOQ9NVS9 261 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 ERVK-19Q9WJR5 959 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 ISM1B1AKI9 464 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 TSPAN15O95858 294 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 MT-CO2P00403 227 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 PRPS1L1P21108 318 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 EDNRAP25101 427 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 KLRC2P26717 231 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 CD47Q08722 323 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.612e-6■■■□□ 18.1
SMG1-211ENST00000565324 SEMA3AQ14563 771 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 ANKDD1AQ495B1 522 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 RAP1GAP2Q684P5 730 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 C3orf33Q6P1S2 294 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 SLC22A16Q86VW1 577 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 SEMA3CQ99985 751 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 COQ10BQ9H8M1 238 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 STARD7Q9NQZ5 370 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 C2orf74A8MZ97 194 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 ARPC2O15144 300 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 RECQL4O94761 1208 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 IL1BP01584 269 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 MT-ND5P03915 603 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 MATN1P21941 496 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 HSD11B1P28845 292 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 C2orf80Q0P641 193 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 ZNF423Q2M1K9 1284 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 PGAP1Q75T13 922 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 ZBTB46Q86UZ6 589 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 GID4Q8IVV7 300 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 FTMTQ8N4E7 242 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 ZBTB2Q8N680 514 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 TNFRSF25Q93038 417 aa5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SMG1-211ENST00000565324 MYO19Q96H55 970 aa5□□□□□ -1.61
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