RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 ANKRD22Q5VYY1 191 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 C11orf96Q7Z7L8 435 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 CARNMT1Q8N4J0 409 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 DENND6BQ8NEG7 585 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 KLHDC9Q8NEP7 349 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 SLC7A14Q8TBB6 771 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 PXYLP1Q8TE99 480 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa5.94□□□□□ -1.46
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