RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533051.5

SLC43A3-222, Transcript of solute carrier family 43 member 3, human

TSL 2

Gene SLC43A3, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC43A3-222	ENST00000533051	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SLC43A3-222	ENST00000533051	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SLC43A3-222	ENST00000533051	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SLC43A3-222	ENST00000533051	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
SLC43A3-222	ENST00000533051	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SLC43A3-222	ENST00000533051	SVIL	O95425	2214 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SLC43A3-222	ENST00000533051	LILRA5	A6NI73	299 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	UBXN7	O94888	489 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	BRAF	P15056	766 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	TYRP1	P17643	537 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	CHRM3	P20309	590 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	IVD	P26440	423 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	FMO4	P31512	558 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	ELK3	P41970	407 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	GPR18	Q14330	331 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	SEMA3A	Q14563	771 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	CRYM	Q14894	314 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	TTC23L	Q6PF05	361 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	CEP112	Q8N8E3	955 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	GPR150	Q8NGU9	434 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	TAAR9	Q96RI9	348 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	CARD6	Q9BX69	1037 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	SGTA	O43765	313 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	RASSF9	O75901	435 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	ESR1	P03372	595 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	RPN2	P04844	631 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	CD1C	P29017	333 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	PREP	P48147	710 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	CD151	P48509	253 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	PLTP	P55058	493 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	PRKAA1	Q13131	559 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	C16orf46	Q6P387	395 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	CCDC25	Q86WR0	208 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	PALM2	Q8IXS6	379 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	FOPNL	Q96NB1	174 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	KLHL3	Q9UH77	587 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	ASF1A	Q9Y294	204 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	TACC2	O95359	2948 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	PCSK5	Q92824	1860 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	BANF1	O75531	89 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	13.87	□□□□□ -0.19	2e-6	■■□□□ 13.9
SLC43A3-222	ENST00000533051	ARNT	P27540	789 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	CTBP1	Q13363	440 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	IRGC	Q6NXR0	463 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	OOSP2	Q86WS3	158 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	KRT222	Q8N1A0	295 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	LCN9	Q8WX39	176 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	STARD8	Q92502	1023 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SLC43A3-222	ENST00000533051	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19

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