RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523251.5

TMPRSS4-214, Transcript of transmembrane serine protease 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene TMPRSS4, Length 1,689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4-214ENST00000523251 PPP6CO00743 305 aa14.66□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 HSPA4LO95757 839 aa14.66□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 FAM107AO95990 144 aa14.66□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 CTSEP14091 401 aa14.66□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 GNSP15586 552 aa14.66□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 TSPAN8P19075 237 aa14.66□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 EPORP19235 508 aa14.66□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 MPSTP25325 297 aa14.66□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 HALP42357 657 aa14.66□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 CLCQ05315 142 aa14.66□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 C1orf61Q13536 156 aa14.66□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 KIF19Q2TAC6 998 aa14.66□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 PTCHD3Q3KNS1 767 aa14.66□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 TTC23LQ6PF05 361 aa14.66□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 AGTRAPQ6RW13 159 aa14.66□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa14.66□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa14.66□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 SYT12Q8IV01 421 aa14.66□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 ZNF781Q8N8C0 355 aa14.66□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 ATL1Q8WXF7 558 aa14.66□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 CCT8L2Q96SF2 557 aa14.66□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 HGH1Q9BTY7 390 aa14.66□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 MVB12BQ9H7P6 319 aa14.66□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 SNX11Q9Y5W9 270 aa14.66□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 ANKRD12Q6UB98 2062 aa14.66□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 A0A1B0GTL3 188 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 PRR33A8MZF0 331 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 K7EPI3 171 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 STK16O75716 305 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 TGDSO95455 350 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 HOXD12P35452 270 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 LCP2Q13094 533 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 IYDQ6PHW0 289 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 AGAP11Q8TF27 550 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 FERD3LQ96RJ6 166 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 NRTNQ99748 197 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 FAM107BQ9H098 131 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 ATG10Q9H0Y0 220 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 SPATA7Q9P0W8 599 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 PLAGL1Q9UM63 463 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 RAP2CQ9Y3L5 183 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 GON4LQ3T8J9 2241 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 OR7A17O14581 309 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 SLC19A1P41440 591 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 NUBP1P53384 320 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 SH3BP2P78314 561 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 PRKAA1Q13131 559 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 PRKG2Q13237 762 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 GTF2H2Q13888 395 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 ELOCQ15369 112 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 SHBQ15464 509 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 CYP2A13Q16696 494 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 TAF8Q7Z7C8 310 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 CUZD1Q86UP6 607 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 CRLF3Q8IUI8 442 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 SFTPA2Q8IWL1 248 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 NAGSQ8N159 534 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 TRPC4APQ8TEL6 797 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 PPP4R1Q8TF05 950 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 PIGKQ92643 395 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 PYCR2Q96C36 320 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 CAMK1GQ96NX5 476 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 IL17FQ96PD4 163 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 ZNF382Q96SR6 550 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 SGPP1Q9BX95 441 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 SLC32A1Q9H598 525 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 PNPOQ9NVS9 261 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 OPTCQ9UBM4 332 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 SPASTQ9UBP0 616 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 ZNF225Q9UK10 706 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa14.65□□□□□ -0.06
TMPRSS4-214ENST00000523251 USP34Q70CQ2 3546 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-214ENST00000523251 E7ENX8 843 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-214ENST00000523251 PIAS2O75928 621 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-214ENST00000523251 WDR47O94967 919 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-214ENST00000523251 PNLIPRP1P54315 467 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-214ENST00000523251 TBPL1P62380 186 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-214ENST00000523251 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-214ENST00000523251 TAP2Q03519 686 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-214ENST00000523251 TRAF3Q13114 568 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-214ENST00000523251 ARHGAP19Q14CB8 494 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-214ENST00000523251 FAM219BQ5XKK7 198 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-214ENST00000523251 PIGWQ7Z7B1 504 aa14.64□□□□□ -0.07
TMPRSS4-214ENST00000523251 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms