RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 OR4M1Q8NGD0 313 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 STYXQ8WUJ0 223 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 VPS39Q96JC1 886 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 PSKH2Q96QS6 385 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 ACAT2Q9BWD1 397 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 ROGDIQ9GZN7 287 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-211ENST00000520276 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
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TRPS1-211ENST00000520276 F5H5T6 163 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SHOXO15266 292 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 FCGR1AP12314 374 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 HSD17B1P14061 328 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 IMPDH1P20839 514 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 MASP1P48740 699 aa9.9□□□□□ -0.83
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TRPS1-211ENST00000520276 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
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TRPS1-211ENST00000520276 BOLA3Q53S33 107 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TTC9BQ8N6N2 239 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PSMG2Q969U7 264 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SLC39A13Q96H72 371 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 C3orf30Q96M34 536 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM74Q96NL1 305 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SPON2Q9BUD6 331 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TAS2R9Q9NYW1 312 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 CFAP97Q9P2B7 532 aa9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
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TRPS1-211ENST00000520276 A0A0J9YYE9 177 aa9.89□□□□□ -0.83
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TRPS1-211ENST00000520276 PRKD3O94806 890 aa9.89□□□□□ -0.83
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TRPS1-211ENST00000520276 DDOSTP39656 456 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 GSK3BP49841 420 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF404Q494X3 552 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 NOXA1Q86UR1 476 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 HS6ST3Q8IZP7 471 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 MCOLN3Q8TDD5 553 aa9.89□□□□□ -0.83
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TRPS1-211ENST00000520276 DCSTAMPQ9H295 470 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SAGE2PA6NJ88 616 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 FAM25AB3EWG3 89 aa9.89□□□□□ -0.83
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TRPS1-211ENST00000520276 TBC1D21Q8IYX1 336 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 EID3Q8N140 333 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 OR52K1Q8NGK4 314 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TTC9Q92623 222 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 MCMBPQ9BTE3 642 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 FADS2O95864 444 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
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TRPS1-211ENST00000520276 PSMB4P28070 264 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 FMO3P31513 532 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 NUDT1P36639 197 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
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TRPS1-211ENST00000520276 LAPTM5Q13571 262 aa9.89□□□□□ -0.83
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TRPS1-211ENST00000520276 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
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TRPS1-211ENST00000520276 GLYATQ6IB77 296 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 HACD2Q6Y1H2 254 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 VN1R2Q8NFZ6 395 aa9.89□□□□□ -0.83
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TRPS1-211ENST00000520276 CNPY3Q9BT09 278 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 POMKQ9H5K3 350 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 C8orf4Q9NR00 106 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 EFCAB9A8MZ26 197 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 LEUTXA8MZ59 168 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 AKR7A2O43488 359 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 GPX3P22352 226 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-211ENST00000520276 IL32P24001 234 aa9.88□□□□□ -0.83
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