RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511392.5

CDV3-208, Transcript of CDV3 homolog, human

TSL 5 BASIC

Gene CDV3, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDV3-208	ENST00000511392	ANXA9	O76027	345 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	NEBL	O76041	1014 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	TMEM63A	O94886	807 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	AP2A1	O95782	977 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	SLC4A1	P02730	911 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	CSF2	P04141	144 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	FGF1	P05230	155 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	HLA-DPA1	P20036	260 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	PSMA3	P25788	255 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	HMGCL	P35914	325 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	GRIA1	P42261	906 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	MAGEA6	P43360	314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	EPHB1	P54762	984 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	GEM	P55040	296 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	C21orf59	P57076	290 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	YPEL5	P62699	121 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	CDK3	Q00526	305 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	NFATC3	Q12968	1075 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	SGCG	Q13326	291 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	SLC14A1	Q13336	389 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	PTPRCAP	Q14761	206 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ACOX1	Q15067	660 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	PARP6	Q2NL67	630 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	DENND2C	Q68D51	928 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	PNCK	Q6P2M8	343 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	USP51	Q70EK9	711 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	TRIM74	Q86UV6	250 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	PARG	Q86W56	976 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	NAXD	Q8IW45	347 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	SLC25A45	Q8N413	288 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	GPR26	Q8NDV2	337 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	AP2M1	Q96CW1	435 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	MENT	Q9BUN1	341 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	APOO	Q9BUR5	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	LRRC61	Q9BV99	259 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	WDR26	Q9H7D7	661 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	GDF3	Q9NR23	364 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	IL17C	Q9P0M4	197 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392		U3KQA8	63 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	USP24	Q9UPU5	2620 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	RP1	P56715	2156 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392		A0A0G2JNJ9	132 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	CCL22	O00626	93 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	TRIM38	O00635	465 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	SCAMP1	O15126	338 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	TP73	O15350	636 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	YKT6	O15498	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	FLRT2	O43155	660 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	SH3BP5	O60239	455 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	IFNB1	P01574	187 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	IVL	P07476	585 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	TSHR	P16473	764 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	DGKA	P23743	735 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	POLD2	P49005	469 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	FNTA	P49354	379 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	HMGA2	P52926	109 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	XIAP	P98170	497 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ARHGEF7	Q14155	803 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	KCNJ11	Q14654	390 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ALS2CL	Q60I27	953 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	GLRX5	Q86SX6	157 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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