RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
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SH3BP2-218ENST00000511185 TUBB2BQ9BVA1 445 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC12A9Q9BXP2 914 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 PDE7BQ9NP56 450 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-218ENST00000511185 POLG2Q9UHN1 485 aa18.09■□□□□ 0.49
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SH3BP2-218ENST00000511185 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
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SH3BP2-218ENST00000511185 KCNMB4Q86W47 210 aa18.08■□□□□ 0.48
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SH3BP2-218ENST00000511185 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 OR1L3Q8NH93 324 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC39A7Q92504 469 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 EXTL1Q92935 676 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 TCF12Q99081 682 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM60AQ9NP50 221 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
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SH3BP2-218ENST00000511185 CHMP2BQ9UQN3 213 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHL20Q9Y2M5 609 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC188H7C350 402 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 ERVK-10P10266 1014 aa18.07■□□□□ 0.48
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SH3BP2-218ENST00000511185 SLC38A9Q8NBW4 561 aa18.07■□□□□ 0.48
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SH3BP2-218ENST00000511185 STARD8Q92502 1023 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 CFAP36Q96G28 342 aa18.07■□□□□ 0.48
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SH3BP2-218ENST00000511185 OR6C2Q9NZP2 312 aa18.07■□□□□ 0.48
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SH3BP2-218ENST00000511185 C1orf105O95561 183 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 PRKAR1AP10644 381 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 CHRM3P20309 590 aa18.06■□□□□ 0.48
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SH3BP2-218ENST00000511185 PAFAH1B1P43034 410 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 GPS2Q13227 327 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 MORF4L2Q15014 288 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 PCGF5Q86SE9 256 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 CT55Q8WUE5 264 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 SNF8Q96H20 258 aa18.06■□□□□ 0.48
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SH3BP2-218ENST00000511185 FBXO5Q9UKT4 447 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 COL6A6A6NMZ7 2263 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGEF33A8MVX0 844 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 ISM1B1AKI9 464 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 E5RI56 91 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 H3BMM5 538 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 RASGRF2O14827 1237 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 NRP2O60462 931 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 HAUS5O94927 633 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 RPN2P04844 631 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 MAGP20916 626 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 GABRA4P48169 554 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 CDC20Q12834 499 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP2-218ENST00000511185 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
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