RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-208ENST00000487290 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 LINC01555Q8NAE3 123 aa16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 OR2L8Q8NGY9 312 aa16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 DENND1AQ8TEH3 1009 aa16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 KLHL6Q8WZ60 621 aa16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 NCSTNQ92542 709 aa16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 TSPAN17Q96FV3 270 aa16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 SLC41A2Q96JW4 573 aa16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 SLC12A9Q9BXP2 914 aa16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 HRASLS2Q9NWW9 162 aa16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 RAB21Q9UL25 225 aa16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 ZFHX4Q86UP3 3567 aa16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 PCM1Q15154 2024 aa16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 FKBP9O95302 570 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 SPINK2P20155 84 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 HSD17B2P37059 387 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 SLC26A3P40879 764 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 MAGEA12P43365 314 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 BDKRB1P46663 353 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 PPP1CAP62136 330 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 KIR2DS3Q14952 304 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 BMPERQ8N8U9 685 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 OR4E2Q8NGC2 313 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 UBXN4Q92575 508 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 DLG3Q92796 817 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 NXPE2Q96DL1 559 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 LINGO1Q96FE5 620 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 UBXN10Q96LJ8 280 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 PAFAH2Q99487 392 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 SYTL2Q9HCH5 934 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 KLK4Q9Y5K2 254 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 OR6C74A6NCV1 312 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 C2orf74A8MZ97 194 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 B4E171 279 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 FAM155BO75949 473 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 TUBBP07437 444 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 MSL3P1P0C860 447 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 STMN1P16949 149 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 CNTFP26441 200 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 GCAP28676 217 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 TSPAN7P41732 249 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 SERPINB9P50453 376 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 RAB10P61026 200 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 PPP1R3AQ16821 1122 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 CCSMST1Q4G0I0 132 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 ANKS6Q68DC2 871 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 EMBQ6PCB8 327 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 TTC23LQ6PF05 361 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 SBSNQ6UWP8 590 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 MARCH9Q86YJ5 346 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 SPNS2Q8IVW8 549 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 MYO1HQ8N1T3 1032 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 AGBL5Q8NDL9 886 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 OR9A1PQ8NGU1 263 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 DCAKDQ8WVC6 231 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 CAVIN3Q969G5 261 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 NRTNQ99748 197 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 CMKLR1Q99788 373 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 DERL2Q9GZP9 239 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 C1GALT1Q9NS00 363 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 BTRCQ9Y297 605 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 LAMA5O15230 3695 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 CCDC189A1A4V9 331 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 PLD2O14939 933 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 SLC35E2BP0CK96 405 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 AP1S2P56377 157 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 PRKAA1Q13131 559 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 ZNF460Q14592 562 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 USP10Q14694 798 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 SLC5A12Q1EHB4 618 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 PHF19Q5T6S3 580 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 SPESP1Q6UW49 350 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 RAB11FIP2Q7L804 512 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 CLEC14AQ86T13 490 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 LSMEM2Q8N112 164 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 CFAP61Q8NHU2 1237 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 ANKRD49Q8WVL7 239 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 TGM7Q96PF1 710 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 OR2A14Q96R47 310 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-208ENST00000487290 XKR8Q9H6D3 395 aa16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms