RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 ST6GAL1P15907 406 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 UGT2B7P16662 529 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 RAB28P51157 221 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 UCNP55089 124 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 ACY1Q03154 408 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 KLHL38Q2WGJ6 581 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 CCSMST1Q4G0I0 132 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 GALNT7Q86SF2 657 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 ZBED8Q8IZ13 594 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 LINC01555Q8NAE3 123 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 RAD51AP1Q96B01 352 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 ELMO2Q96JJ3 720 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 FOPNLQ96NB1 174 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 GPR21Q99679 349 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 CPNE5Q9HCH3 593 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 MOCS1Q9NZB8 636 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 DHRS7Q9Y394 339 aa20.27■□□□□ 0.84
ACTB-211ENST00000480301 RAD1O60671 282 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 SPAG6O75602 509 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 STK17BO94768 372 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 PVRP15151 417 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 ZNF28P17035 718 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 CD9P21926 228 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 TMPRSS3P57727 454 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 CXADRP78310 365 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 TUBB3Q13509 450 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 TTC23LQ6PF05 361 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 TRIM73Q86UV7 250 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R3BQ86XI6 285 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 CD200R1Q8TD46 325 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 INPP5DQ92835 1189 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 NDNQ99608 321 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 RAB17Q9H0T7 212 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 PDE7BQ9NP56 450 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 FGF21Q9NSA1 209 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 SOHLH2Q9NX45 425 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 MRFAP1Q9Y605 127 aa20.26■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 RASGRF2O14827 1237 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 CCNFP41002 786 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 ATP1A2P50993 1020 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 PLTPP55058 493 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 TUBB4BP68371 445 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 CUL1Q13616 776 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 TUBB2AQ13885 445 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 GPR19Q15760 415 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 TTLL9Q3SXZ7 439 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 TMTC4Q5T4D3 741 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 CYB5D1Q6P9G0 228 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 ZDHHC24Q6UX98 284 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 CYHR1Q6ZMK1 362 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 NEK10Q6ZWH5 1172 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 VASH2Q86V25 355 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 OR2L8Q8NGY9 312 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 RNF31Q96EP0 1072 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 LRRC1Q9BTT6 524 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 KLHL25Q9H0H3 589 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 SAYSD1Q9NPB0 183 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 WDR70Q9NW82 654 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 RARRES3Q9UL19 164 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 SLC39A10Q9ULF5 831 aa20.25■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 KRT87PA6NCN2 255 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 ISM1B1AKI9 464 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 VPS26AO75436 327 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 TIAF1O95411 115 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 SLC7A5Q01650 507 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 CAV1Q03135 178 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 KIR2DS3Q14952 304 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 SLC5A12Q1EHB4 618 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 MANEAQ5SRI9 462 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 CCDC81Q6ZN84 652 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 RASGRP3Q8IV61 690 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 NLGN4XQ8N0W4 816 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 FBXO25Q8TCJ0 367 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 DENND1AQ8TEH3 1009 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 PYROXD1Q8WU10 500 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
ACTB-211ENST00000480301 ULBP3Q9BZM4 244 aa20.24■□□□□ 0.83
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