RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465896.5

PHC3-201, Transcript of polyhomeotic homolog 3, humanhuman

TSL 5

Gene PHC3, Length 538 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC3-201ENST00000465896 DBN1Q16643 649 aa11.67□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa11.67□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 SERPINA9Q86WD7 417 aa11.67□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 PARP9Q8IXQ6 854 aa11.67□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 GPR135Q8IZ08 494 aa11.67□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 DNAJB14Q8TBM8 379 aa11.67□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 PSMF1Q92530 271 aa11.67□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 RELTQ969Z4 430 aa11.67□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 VAT1Q99536 393 aa11.67□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 COPS8Q99627 209 aa11.67□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 AP1M1Q9BXS5 423 aa11.67□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa11.67□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 SYNPO2LQ9H987 977 aa11.67□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 ENAMQ9NRM1 1142 aa11.67□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa11.67□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa11.67□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 IFNKQ9P0W0 207 aa11.67□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 CTSFQ9UBX1 484 aa11.67□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 NDOR1Q9UHB4 597 aa11.67□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 LCMT1Q9UIC8 334 aa11.67□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 SLC5A10A0PJK1 596 aa11.66□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 VSTM2BA6NLU5 285 aa11.66□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 MAGP20916 626 aa11.66□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 MC4RP32245 332 aa11.66□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 EFNA3P52797 238 aa11.66□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 RIPPLY3P57055 190 aa11.66□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 RPA4Q13156 261 aa11.66□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 TFDP2Q14188 446 aa11.66□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 CDSNQ15517 529 aa11.66□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 CYP2A13Q16696 494 aa11.66□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 FCRL6Q6DN72 434 aa11.66□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 OVCH1Q7RTY7 1134 aa11.66□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa11.66□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 OR11G2Q8NGC1 345 aa11.66□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 KRT35Q92764 455 aa11.66□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 ULK4Q96C45 1275 aa11.66□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 ZNF285Q96NJ3 590 aa11.66□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 FSD1LQ9BXM9 530 aa11.66□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 SLC26A1Q9H2B4 701 aa11.66□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 ARNT2Q9HBZ2 717 aa11.66□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 EURLQ9NYK6 297 aa11.66□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 TFR2Q9UP52 801 aa11.66□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 OR51F1A6NGY5 319 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 C2orf81A6NN90 581 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 H7C0S8 307 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 PCDH17O14917 1159 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 MBD3O95983 291 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 IGHEP01854 428 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 ITGALP20701 1170 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 PSMA3P25788 255 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 MST1P26927 711 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 SOX11P35716 441 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 GEMP55040 296 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 KRTAP10-9P60411 292 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 CDC16Q13042 620 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 SLC5A12Q1EHB4 618 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 TFDP3Q5H9I0 405 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 KCTD11Q693B1 232 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 TLDC1Q6P9B6 456 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 TTLL10Q6ZVT0 673 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 BBS12Q6ZW61 710 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 VRK3Q8IV63 474 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 OR5K2Q8NHB8 316 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 TM9SF4Q92544 642 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 P3H4Q92791 437 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 FKBP10Q96AY3 582 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 DCUN1D1Q96GG9 259 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 CNDP1Q96KN2 507 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 FAM118BQ9BPY3 351 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 C19orf43Q9BQ61 176 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 C17orf62Q9BQA9 187 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 HEMGNQ9BXL5 484 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 TRIM8Q9BZR9 551 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 WDR54Q9H977 334 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 CIDEBQ9UHD4 219 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 TRHDEQ9UKU6 1024 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 PLCL2Q9UPR0 1127 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 ALG6Q9Y672 507 aa11.65□□□□□ -0.54
PHC3-201ENST00000465896 ITPR3Q14573 2671 aa11.64□□□□□ -0.55
PHC3-201ENST00000465896 MTORP42345 2549 aa11.64□□□□□ -0.55
PHC3-201ENST00000465896 CACNA1CQ13936 2221 aa11.64□□□□□ -0.55
PHC3-201ENST00000465896 KRT87PA6NCN2 255 aa11.64□□□□□ -0.55
PHC3-201ENST00000465896 HACD1B0YJ81 288 aa11.64□□□□□ -0.55
PHC3-201ENST00000465896 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PHC3-201ENST00000465896 PSTPIP1O43586 416 aa11.64□□□□□ -0.55
PHC3-201ENST00000465896 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PHC3-201ENST00000465896 JRKO75564 520 aa11.64□□□□□ -0.55
PHC3-201ENST00000465896 CELA2AP08217 269 aa11.64□□□□□ -0.55
PHC3-201ENST00000465896 PKLRP30613 574 aa11.64□□□□□ -0.55
PHC3-201ENST00000465896 SHMT2P34897 504 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms