RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439365.6

NPAS1-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NPAS1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1-201ENST00000439365 SGSM3Q96HU1 749 aa18.9■□□□□ 0.62
NPAS1-201ENST00000439365 TRIM55Q9BYV6 548 aa18.9■□□□□ 0.62
NPAS1-201ENST00000439365 FAM60AQ9NP50 221 aa18.9■□□□□ 0.62
NPAS1-201ENST00000439365 GNPTGQ9UJJ9 305 aa18.9■□□□□ 0.62
NPAS1-201ENST00000439365 TCFL5Q9UL49 500 aa18.9■□□□□ 0.62
NPAS1-201ENST00000439365 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
NPAS1-201ENST00000439365 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa18.9■□□□□ 0.62
NPAS1-201ENST00000439365 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa18.89■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 TPBGLP0DKB5 382 aa18.89■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 MGAT1P26572 445 aa18.89■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 NMBRP28336 390 aa18.89■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 KIR2DS3Q14952 304 aa18.89■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 ZIC1Q15915 447 aa18.89■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 C1orf189Q5VU69 101 aa18.89■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 TTC23LQ6PF05 361 aa18.89■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 TAX1BP1Q86VP1 789 aa18.89■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 PANX3Q96QZ0 392 aa18.89■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 ING2Q9H160 280 aa18.89■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 HOMER3Q9NSC5 361 aa18.89■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 SLC39A10Q9ULF5 831 aa18.89■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 PTGIRP43119 386 aa18.88■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 VPS41P49754 854 aa18.88■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 RAB28P51157 221 aa18.88■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 IGFBP7Q16270 282 aa18.88■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 MLIPQ5VWP3 458 aa18.88■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 CES3Q6UWW8 571 aa18.88■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 FAM20CQ8IXL6 584 aa18.88■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 SLC25A23Q9BV35 468 aa18.88■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 TREX1Q9NSU2 369 aa18.88■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 SYBUQ9NX95 663 aa18.88■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 CDYLQ9Y232 598 aa18.88■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa18.88■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 MYO18BQ8IUG5 2567 aa18.87■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 GPC4O75487 556 aa18.87■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 VAPBO95292 243 aa18.87■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 AOAHP28039 575 aa18.87■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 PKLRP30613 574 aa18.87■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 SARNPP82979 210 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 NCF4Q15080 339 aa18.87■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 SLC5A12Q1EHB4 618 aa18.87■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 LRRC8BQ6P9F7 803 aa18.87■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 FAM198BQ6UWH4 519 aa18.87■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 UNC5DQ6UXZ4 953 aa18.87■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 OTOAQ7RTW8 1153 aa18.87■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa18.87■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa18.87■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 MFSD3Q96ES6 412 aa18.87■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 IL17FQ96PD4 163 aa18.87■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 TXLNGQ9NUQ3 528 aa18.87■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 PADI2Q9Y2J8 665 aa18.87■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 KLHL20Q9Y2M5 609 aa18.87■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 GOLGA8KD6RF30 607 aa18.86■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 GOLGA8TH3BQL2 631 aa18.86■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 PFDN6O15212 129 aa18.86■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 HCRTR1O43613 425 aa18.86■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 TMEM63AO94886 807 aa18.86■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 MAGP20916 626 aa18.86■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 PGDP52209 483 aa18.86■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 KYNUQ16719 465 aa18.86■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 MRNIPQ6NTE8 343 aa18.86■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 CASC4Q6P4E1 433 aa18.86■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 MPP5Q8N3R9 675 aa18.86■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa18.86■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 SLC22A18Q96BI1 424 aa18.86■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa18.85■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 KPNA5O15131 536 aa18.85■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 SLCO2B1O94956 709 aa18.85■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 PDGFAP04085 211 aa18.85■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 CAPN1P07384 714 aa18.85■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 CBSLP0DN79 551 aa18.85■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 TPSB2P20231 275 aa18.85■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 CD9P21926 228 aa18.85■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 FMO4P31512 558 aa18.85■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 OTX2P32243 289 aa18.85■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 CBSP35520 551 aa18.85■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 CDK16Q00536 496 aa18.85■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 GPS1Q13098 491 aa18.85■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 SLC9A5Q14940 896 aa18.85■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 SF1Q15637 639 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 TPSAB1Q15661 275 aa18.85■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 LRRC6Q86X45 466 aa18.85■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 RAB42Q8N4Z0 105 aa18.85■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 PRELID2Q8N945 189 aa18.85■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 LINC01555Q8NAE3 123 aa18.85■□□□□ 0.61
NPAS1-201ENST00000439365 FOPNLQ96NB1 174 aa18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms