RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428361.5

CTDSP1-202, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 842 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-202ENST00000428361 S1PR4O95977 384 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 CCDC175P0C221 793 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 PVRP15151 417 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 PTGIRP43119 386 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 NPY2RP49146 381 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 CCL11P51671 97 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 SARNPP82979 210 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 SNX1Q13596 522 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 MEI1Q5TIA1 1274 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 ZNF662Q6ZS27 426 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 GAS2L3Q86XJ1 694 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 TRIM58Q8NG06 486 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 MAGEC3Q8TD91 643 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 NDC1Q9BTX1 674 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 TRIM55Q9BYV6 548 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 KLHL25Q9H0H3 589 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 A0A0U1RQJ8 604 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 TTLL8A6PVC2 850 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 PEX12O00623 359 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 OR1I1O60431 355 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 VPS4BO75351 444 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 DNAJB5O75953 348 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 NR1D1P20393 614 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 PKLRP30613 574 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 CD97P48960 835 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 ARSFP54793 590 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 BASP1P80723 227 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 DCDP81605 110 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 SSPNQ14714 243 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 NAA25Q14CX7 972 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 KYNUQ16719 465 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 PTCHD3Q3KNS1 767 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 CPZQ66K79 652 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 MRNIPQ6NTE8 343 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 MIB2Q96AX9 1013 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 FOPNLQ96NB1 174 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 MLXIPLQ9NP71 852 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 SLC39A10Q9ULF5 831 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 VPS4AQ9UN37 437 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 SPTBP11277 2137 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 H3BMM5 538 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 GPC4O75487 556 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 NDUFS3O75489 264 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 CEACAM4O75871 244 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 SLCO2B1O94956 709 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 ALPPP05187 535 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 PAMP19021 973 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 CD9P21926 228 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 CCR7P32248 378 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 CCNFP41002 786 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 FOLR3P41439 243 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 GRIA1P42261 906 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 IGFBP7Q16270 282 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 COLEC12Q5KU26 742 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 ZNF534Q76KX8 674 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 OTOAQ7RTW8 1153 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 TRIM73Q86UV7 250 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 FAM26EQ8N5C1 309 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 OTUD6BQ8N6M0 293 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 GLIS1Q8NBF1 620 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 CLEC1AQ8NC01 280 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 RAD51AP1Q96B01 352 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 NACC2Q96BF6 587 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 VPS50Q96JG6 964 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 FAM60AQ9NP50 221 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 GPR83Q9NYM4 423 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 C5AR2Q9P296 337 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 CAPN1P07384 714 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 AOAHP28039 575 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 RPL22P35268 128 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 CHAF1BQ13112 559 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 DEFB110Q30KQ9 67 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 TCTE1Q5JU00 501 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 MLIPQ5VWP3 458 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 OR2L8Q8NGY9 312 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 CFAP61Q8NHU2 1237 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 ZNF778Q96MU6 729 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 TCF12Q99081 682 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms