RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414620.1

ACTB-202, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-202ENST00000414620 PCM1Q15154 2024 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 A6NL46 340 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 F8W8V4 182 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 ZNF185O15231 689 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 NMBRP28336 390 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 OTX2P32243 289 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 KCNJ1P48048 391 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 GABRA4P48169 554 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 FOXL2P58012 376 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 ATP1A4Q13733 1029 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 NADK2Q4G0N4 442 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 MLIPQ5VWP3 458 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 ZBTB2Q8N680 514 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 OTUD6BQ8N6M0 293 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 TCTN2Q96GX1 697 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 TSSK1BQ9BXA7 367 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 OR6C2Q9NZP2 312 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 LUZP4Q9P127 313 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 CDYLQ9Y232 598 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 KDM1AO60341 852 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 APOA4P06727 396 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 HBQ1P09105 142 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 MAGP20916 626 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 BDKRB1P46663 353 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 RAPSNQ13702 412 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 CCNG2Q16589 344 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 PCID2Q5JVF3 399 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 CES3Q6UWW8 571 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 NLRP9Q7RTR0 991 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 GSTA5Q7RTV2 222 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 LINC01555Q8NAE3 123 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 FDCSPQ8NFU4 85 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 ASZ1Q8WWH4 475 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 CARD6Q9BX69 1037 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 PADI2Q9Y2J8 665 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 SHANK1Q9Y566 2161 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 KRT87PA6NCN2 255 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 TTLL8A6PVC2 850 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 H3BMH7 237 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 GPC4O75487 556 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 FGGP02679 453 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 MGAT1P26572 445 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 RAB28P51157 221 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 KIR2DS3Q14952 304 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 TMED2Q15363 201 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 KYNUQ16719 465 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 SLC5A12Q1EHB4 618 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 RAB43Q86YS6 212 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 TMEM151BQ8IW70 566 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 DNAJC22Q8N4W6 341 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 PEX13Q92968 403 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 GBP5Q96PP8 586 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 MENTQ9BUN1 341 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 NUDT9Q9BW91 350 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 MFRPQ9BY79 579 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 TREX1Q9NSU2 369 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 TXLNGQ9NUQ3 528 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 SYBUQ9NX95 663 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 NDOR1Q9UHB4 597 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 GOLGA8KD6RF30 607 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 GOLGA8TH3BQL2 631 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 CEP104O60308 925 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 NDUFS3O75489 264 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 RPN2P04844 631 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 CCDC175P0C221 793 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 AOAHP28039 575 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 CXCR5P32302 372 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 UQCRFS1P47985 274 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 TTPAP49638 278 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 VPS41P49754 854 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 GRB7Q14451 532 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 RHBDD2Q6NTF9 364 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 ATCAYQ86WG3 371 aa14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms