RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

BASIC

Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 NKD1Q969G9 470 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM159Q96B96 161 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 LRRC39Q96DD0 335 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ELMO2Q96JJ3 720 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 SLC41A2Q96JW4 573 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 DCBLD2Q96PD2 775 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 PANX3Q96QZ0 392 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 TAAR9Q96RI9 348 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 TTC1Q99614 292 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CMKLR1Q99788 373 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 DPYSL5Q9BPU6 564 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 NAT9Q9BTE0 207 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 PITPNM3Q9BZ71 974 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 KLHL25Q9H0H3 589 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 EPB41L1Q9H4G0 881 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 MVB12BQ9H7P6 319 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 VPS37BQ9H9H4 285 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 SAYSD1Q9NPB0 183 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 SLC39A1Q9NY26 324 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ACTR10Q9NZ32 417 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 KLHL42Q9P2K6 505 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ACSL6Q9UKU0 697 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 POMT2Q9UKY4 750 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ASF1AQ9Y294 204 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 KLHL20Q9Y2M5 609 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 VWA7Q9Y334 891 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 PCSK5Q92824 1860 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 MED13Q9UHV7 2174 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 SCN2AQ99250 2005 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CACNA1GO43497 2377 aa3.36□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 GSAPA4D1B5 854 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CTAGE15A4D2H0 777 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 TLCD2A6NGC4 264 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 FAM159BA6NKW6 160 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 H3BMM5 538 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 MYO1CO00159 1063 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 TERTO14746 1132 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 KPNA5O15131 536 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 KLK10O43240 276 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ZW10O43264 779 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 SPAG6O75602 509 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 RASSF9O75901 435 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 MED26O95402 600 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 DLGAP3O95886 979 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 TUBB4AP04350 444 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 APOA4P06727 396 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 JMJD7P0C870 316 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CTAGE8P0CG41 777 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 MPC1LP0DKB6 136 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 MYBL2P10244 700 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 FGF5P12034 268 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 UGT2B7P16662 529 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CD9P21926 228 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 MCM3P25205 808 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 PSMB5P28074 263 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 GCAP28676 217 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 IMPA1P29218 277 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ATP5DP30049 168 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 SHMT2P34897 504 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 GCGRP47871 477 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CSRP3P50461 194 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 RAB28P51157 221 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 TAS2R39P59534 338 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 HSD11B2P80365 405 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CALCOCO2Q13137 446 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 TUBB2AQ13885 445 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 KRT33BQ14525 404 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CYP2A13Q16696 494 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 COL28A1Q2UY09 1125 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 LCN10Q6JVE6 187 aa3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms