RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384139.1

RNU6-187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-187P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-187P-201ENST00000384139 XGP55808 180 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 ANAPC15P60006 121 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRKCEQ02156 737 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRKAA1Q13131 559 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 NR1D2Q14995 579 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 DLG2Q15700 870 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 ISXQ2M1V0 245 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 C9orf66Q5T8R8 295 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 LIN54Q6MZP7 749 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 CCDC174Q6PII3 467 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 LRRC31Q6UY01 552 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMTC2Q8N394 836 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 RASGEF1CQ8N431 466 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR4Q3Q8NH05 313 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 KIAA1524Q8TCG1 905 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 SPPL2AQ8TCT8 520 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 SDCCAG3Q96C92 435 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 CCDC136Q96JN2 1154 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 DGAT2Q96PD7 388 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 SPAG5Q96R06 1193 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 SP140LQ9H930 580 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 A4GALTQ9NPC4 353 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 INPP5EQ9NRR6 644 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 SMC4Q9NTJ3 1288 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 STK26Q9P289 416 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 ABCG2Q9UNQ0 655 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 ASTN1O14525 1302 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF541Q9H0D2 1346 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 A0A0U1RQK1 487 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 A0A1B0GTH9 108 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 PDHXO00330 501 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 KCNK5O95279 499 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 MT-ND1P03886 318 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 ARL14EPLP0DKL9 152 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 ABCB4P21439 1286 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 CDAP32320 146 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRKAA2P54646 552 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 TFAP4Q01664 338 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 ACY1Q03154 408 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 TAB1Q15750 504 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 PFKFB4Q16877 469 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 WSCD2Q2TBF2 565 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 GRAMD1BQ3KR37 738 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF805Q5CZA5 627 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 NAA35Q5VZE5 725 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 PGBD2Q6P3X8 592 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 MYO1HQ8N1T3 1032 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 PLD5Q8N7P1 536 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF527Q8NB42 609 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR13C3Q8NGS6 347 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 ITLN1Q8WWA0 313 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLCO4A1Q96BD0 722 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 HEMGNQ9BXL5 484 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 MTMR12Q9C0I1 747 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 TAOK3Q9H2K8 898 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 PLEKHA3Q9HB20 300 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 SENP1Q9P0U3 644 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 MMACHCQ9Y4U1 282 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 TSPAN3O60637 253 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 AOC1P19801 751 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 JAK1P23458 1154 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 GDF1P27539 372 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 RPA1P27694 616 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 CST5P28325 142 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRCPP42785 496 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 MEOX2P50222 304 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 NDST2P52849 883 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 PDX1P52945 283 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 STX17P56962 302 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 CREB5Q02930 508 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 GAGE2BQ13066 116 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 SGCGQ13326 291 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP0.31□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 CDH18Q13634 790 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 SQLEQ14534 574 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 ANKRD1Q15327 319 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 GAGE2EQ4V326 116 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 ANKRD45Q5TZF3 282 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 GAGE2AQ6NT46 116 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 GALNT5Q7Z7M9 940 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 CCDC190Q86UF4 302 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
RNU6-187P-201ENST00000384139 UBQLNLQ8IYU4 475 aa0.31□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms