RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334268.8

TRDN-201, Transcript of triadin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 4,770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-201ENST00000334268 LGSNQ5TDP6 509 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 LIN54Q6MZP7 749 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 C11orf63Q6NUN7 778 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 FBXL22Q6P050 247 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CLEC9AQ6UXN8 241 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 THSD4Q6ZMP0 1018 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 KCTD9Q7L273 389 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CFAP52Q8N1V2 620 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SH3RF2Q8TEC5 729 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 RLN3Q8WXF3 142 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 OVCA2Q8WZ82 227 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SGCDQ92629 289 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 DIO2Q92813 273 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 MVB12AQ96EY5 273 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TEKT5Q96M29 485 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ZIM3Q96PE6 472 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 FCRL4Q96PJ5 515 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CCT8L2Q96SF2 557 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 BTBD2Q9BX70 525 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CD320Q9NPF0 282 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CD274Q9NZQ7 290 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 KLHL14Q9P2G3 628 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 OR12D3Q9UGF7 316 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 DNMT3LQ9UJW3 386 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CYP8B1Q9UNU6 501 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ERVK-11Q9UQG0 969 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PADI2Q9Y2J8 665 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 HS3ST4Q9Y661 456 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SPTBN4Q9H254 2564 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ZNF292O60281 2723 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CCDC162PA2VCL2 907 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 KRBA1A5PL33 1030 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CYR61O00622 381 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 F9P00740 461 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 IL1AP01583 271 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 GOT1P17174 413 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 NFKB1P19838 968 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 FSHRP23945 695 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CCR1P32246 355 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 FASLGP48023 281 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 GALK1P51570 392 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 GDF10P55107 478 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 UBE2KP61086 200 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 BDH1Q02338 343 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ATP1A4Q13733 1029 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CYP2A13Q16696 494 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 MS4A13Q5J8X5 152 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PITRM1Q5JRX3 1037 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TCTE1Q5JU00 501 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 HES5Q5TA89 166 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 MANEALQ5VSG8 457 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PRAMEF20Q5VT98 475 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 KANK2Q63ZY3 851 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TMEM25Q86YD3 366 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CCDC28AQ8IWP9 274 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 IFT20Q8IY31 132 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 GHDCQ8N2G8 530 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 OR6C4Q8NGE1 309 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PCDH19Q8TAB3 1148 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 WFDC5Q8TCV5 224 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CHTF18Q8WVB6 975 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 IGSF8Q969P0 613 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 HDAC11Q96DB2 347 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TSPAN17Q96FV3 270 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SNF8Q96H20 258 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SERPINB11Q96P15 392 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ADGRE3Q9BY15 652 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 MAGEH1Q9H213 219 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PLGRKTQ9HBL7 147 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ZFP69BQ9UJL9 534 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CDH7Q9ULB5 785 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 COQ6Q9Y2Z9 468 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms