RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNMB4Q86W47 210 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC01555Q8NAE3 123 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 GSDMBQ8TAX9 411 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 CALML6Q8TD86 181 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNF8Q96H20 258 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL17FQ96PD4 163 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 FCRL4Q96PJ5 515 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM167BQ9BTA0 163 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC12A9Q9BXP2 914 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLAC1Q9HBJ0 212 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 LATS2Q9NRM7 1088 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXO5Q9UKT4 447 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 MED16Q9Y2X0 877 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHRM3P20309 590 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 CASQ1P31415 396 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLCN7P51798 805 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITGA8P53708 1063 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYP4F2P78329 520 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCSMST1Q4G0I0 132 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPANXN3Q5MJ09 141 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNSTQ6PJW8 725 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYT10Q6XYQ8 523 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR8K5Q8NH50 307 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 GIMAP7Q8NHV1 300 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC30A3Q99726 388 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM31Q9BZY9 425 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL17BQ9UHF5 180 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A0J9YY10 115 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRT87PA6NCN2 255 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 E5RI56 91 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMAPO00193 183 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 TERTO14746 1132 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 RASGRF2O14827 1237 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1orf105O95561 183 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTC4O95801 387 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 MSL3P1P0C860 447 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIR2DS3Q14952 304 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZIC1Q15915 447 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC5A12Q1EHB4 618 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACSBG2Q5FVE4 666 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPNS2Q8IVW8 549 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDIK1LQ8N165 341 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2L8Q8NGY9 312 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR1L3Q8NH93 324 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC45A3Q96JT2 553 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAT9Q9BTE0 207 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 FANCEQ9HB96 536 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHMP2BQ9UQN3 213 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 EFCAB8A8MWE9 144 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 ISM1B1AKI9 464 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM150CB9EJG8 249 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCRG1O75711 98 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 MATN4O95460 622 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 MT-ND3P03897 115 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 NTRK1P04629 796 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERVK-10P10266 1014 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD9P21926 228 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 F8A1P23610 371 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 ELK3P41970 407 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPL21P46778 160 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 C2orf54Q08AI8 447 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIF1AQ16665 826 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAX1BP1Q86VP1 789 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM126BQ8IUX1 230 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNTN4Q8IWV2 1026 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPATA4Q8NEY3 305 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 DENND1AQ8TEH3 1009 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC39A7Q92504 469 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNJ9Q92806 393 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAD51AP1Q96B01 352 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 WBP1Q96G27 269 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOPNLQ96NB1 174 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 EFHD1Q9BUP0 239 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYTL2Q9HCH5 934 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM60AQ9NP50 221 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 CROTQ9UKG9 612 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 HAUS5O94927 633 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 DLSTP36957 453 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCNFP41002 786 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 GABRA4P48169 554 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms