RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320031.12

ITGA3-202, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGA3, Length 4,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF366Q8N895 744 aa16.17■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 LRTOMTQ8WZ04 291 aa16.17■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 LRRC58Q96CX6 371 aa16.17■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 EBF3Q9H4W6 596 aa16.17■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 TMED5Q9Y3A6 229 aa16.17■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 USP3Q9Y6I4 520 aa16.17■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 FAM189A1O60320 539 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 MED26O95402 600 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 DMPKQ09013 629 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 KLHDC10Q6PID8 442 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 ARMC8Q8IUR7 673 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 TCEAL8Q8IYN2 117 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 PHIPQ8WWQ0 1821 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 PSMA3P25788 255 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 NRIP1P48552 1158 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 ARMCX4Q5H9R4 360 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 TTC9BQ8N6N2 239 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 TTLQ8NG68 377 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 TRIM24O15164 1050 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 THRBP10828 461 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 CD68P34810 354 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 CLCN4P51793 760 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 TRAF3Q13114 568 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 FAM92BQ6ZTR7 304 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 SVOPLQ8N434 492 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 ARL10Q8N8L6 244 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 XAGE5Q8WWM1 108 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 RASSF5Q8WWW0 418 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 SLC2A11Q9BYW1 496 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 MTMR10Q9NXD2 777 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 WASH4PA8MWX3 477 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 VARSP26640 1264 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 TALDO1P37837 337 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 ATP4BP51164 291 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 TAZQ16635 292 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 PCDH7O60245 1069 aa16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 CD1DP15813 335 aa16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 SLC22A14Q9Y267 594 aa16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 IGFBP5P24593 272 aa16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 HNF1BP35680 557 aa16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 MTPNP58546 118 aa16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 C2orf27AQ580R0 203 aa16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 TAF8Q7Z7C8 310 aa16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 FAM149AA5PLN7 773 aa16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 UGT2B17O75795 530 aa16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 POP7O75817 140 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 RAP2AP10114 183 aa16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 CTSAP10619 480 aa16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 PFKLP17858 780 aa16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 NDUFS1P28331 727 aa16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 NDUFA9Q16795 377 aa16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 FLCNQ8NFG4 579 aa16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 OR7A2PQ8NGA2 310 aa16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF778Q96MU6 729 aa16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 ADAMDEC1O15204 470 aa16.14■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 IFNW1P05000 195 aa16.14■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 NCK1P16333 377 aa16.14■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 MAPK10P53779 464 aa16.14■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 ITGA1P56199 1179 aa16.14■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 SPIN4Q56A73 249 aa16.14■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa16.14■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa16.14■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 THAP5Q7Z6K1 395 aa16.14■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 CD244Q9BZW8 370 aa16.14■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 HMG20AQ9NP66 347 aa16.14■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.18
ITGA3-202ENST00000320031 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 MANBAO00462 879 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 BMP7P18075 431 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 CCNA2P20248 432 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 CDH3P22223 829 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF805Q5CZA5 627 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 PIK3C3Q8NEB9 887 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 CASD1Q96PB1 797 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 TRIB3Q96RU7 358 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF382Q96SR6 550 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 PREBQ9HCU5 417 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 LOC730098B7Z3J9 87 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 CCR8P51685 355 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 NR1D2Q14995 579 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 PTCHD3Q3KNS1 767 aa16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.3 ms