RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303230.5

HCN1-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN1, Length 9,885 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN1-201ENST00000303230 GXYLT1Q4G148 440 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 ZFP3Q96NJ6 502 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 A0A0U1RQJ8 604 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 CCL15Q16663 113 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 MIPEPQ99797 713 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 BTBD1Q9H0C5 482 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 TMEM59LQ9UK28 342 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 PACSIN3Q9UKS6 424 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 HCN1O60741 890 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 KRT33AO76009 404 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 FAM171A1Q5VUB5 890 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 MEDAGQ5VYS4 303 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 RGPD1P0DJD0 1748 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 MAGP20916 626 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 SLC18A2Q05940 514 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 ATP6AP1Q15904 470 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 SLC22A10Q63ZE4 541 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 DNASE1L2Q92874 299 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 FUZQ9BT04 418 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 COMMD3Q9UBI1 195 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 ZNF208O43345 1280 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 PRKYO43930 277 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 SPAM1P38567 509 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 EMC10Q5UCC4 262 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 CRYBG2Q8N1P7 616 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 MAT2BQ9NZL9 334 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 CNTN3Q9P232 1028 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 IKZF2Q9UKS7 526 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 C10orf71Q711Q0 1435 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 ACVR2AP27037 513 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 RAET1GQ6H3X3 334 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 TM9SF3Q9HD45 589 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa16.62■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 CKAP5Q14008 2032 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 A0A1B0GVI7 797 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 A0A1W2PP18 115 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 GNAO1P09471 354 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 BDNFP23560 247 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 CRISP3P54108 245 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 PFKPQ01813 784 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 DCDC5Q6ZRR9 648 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 UBXN7O94888 489 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 RPA4Q13156 261 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 ZNF563Q8TA94 476 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 TLR6Q9Y2C9 796 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 C2orf71A6NGG8 1288 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 DNASE1L3Q13609 305 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 KANK2Q63ZY3 851 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 TATDN1Q6P1N9 297 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 LIX1Q8N485 282 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 SLC45A3Q96JT2 553 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 ITM2AO43736 263 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 GADD45GO95257 159 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 SPARCP09486 303 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 AQP1P29972 269 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 OR52J3Q8NH60 311 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 CACNA1SQ13698 1873 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 FAM149AA5PLN7 773 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 FPR1P21462 350 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 CD40LGP29965 261 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 PCDH19Q8TAB3 1148 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 CYP2W1Q8TAV3 490 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 IPPKQ9H8X2 491 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 ENDOD1O94919 500 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 PKMP14618 531 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 OR3A3P47888 321 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 OR3A2P47893 321 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 TREM1Q9NP99 234 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 UBQLNLQ8IYU4 475 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 KCNN1Q92952 543 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 FMO3P31513 532 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa16.61■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 ZNF81P51508 661 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 MED27Q6P2C8 311 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 ASB12Q8WXK4 309 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 CEP295NLQ96MC4 621 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 SLC39A3Q9BRY0 314 aa16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms