RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 GGT1P19440 569 aa14.99□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 DNAJB1P25685 340 aa14.99□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 CTSKP43235 329 aa14.99□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 PSMD8P48556 350 aa14.99□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 TTPAP49638 278 aa14.99□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 RAB25P57735 213 aa14.99□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.99□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 PDZK1Q5T2W1 519 aa14.99□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 FBXL22Q6P050 247 aa14.99□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 TSGA13Q96PP4 275 aa14.99□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 OSBPL10Q9BXB5 764 aa14.99□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 MALT1Q9UDY8 824 aa14.99□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 NINQ8N4C6 2090 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 TMCC2O75069 709 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 FDXRP22570 491 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 GADD45AP24522 165 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 CRATP43155 626 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 CNPPD1Q9BV87 410 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 TIGARQ9NQ88 270 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 TMLHEQ9NVH6 421 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 ANKMY1Q9P2S6 941 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 RNF6Q9Y252 685 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 ASB1Q9Y576 335 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 H3BN98 237 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 SOCS7O14512 581 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 NDST3O95803 873 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 FABP3P05413 133 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 RHOCP08134 193 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 OR4F3Q6IEY1 312 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 OR2T5Q6IEZ7 315 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 CYHR1Q6ZMK1 362 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 GPR156Q8NFN8 814 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 OR2T29Q8NH02 315 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 ATOH8Q96SQ7 321 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 TMEM246Q9BRR3 403 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 SPASTQ9UBP0 616 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 A0A0D9SEW6 157 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 PTGESO14684 152 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 FGF4P08620 206 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 MTHFD2P13995 350 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 ITPKAP23677 461 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 CYP4F8P98187 520 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 SEMA3BQ13214 749 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 ZBTB6Q15916 424 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 PLEKHG6Q3KR16 790 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 GALNT12Q8IXK2 581 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 C3orf58Q8NDZ4 430 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 RNF167Q9H6Y7 350 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 PCTPQ9UKL6 214 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 SNX6Q9UNH7 406 aa14.98□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 LCHNA4D1U4 455 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 ARL5CA6NH57 179 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 KPNA5O15131 536 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 CPNE6O95741 557 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 STEAP3Q658P3 488 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 PM20D1Q6GTS8 502 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 TCAIMQ8N3R3 496 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 ENKURQ8TC29 256 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 NT5C3BQ969T7 300 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 SNTG1Q9NSN8 517 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 SNX4O95219 450 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 ATP6V1E1P36543 226 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 PSEN2P49810 448 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 SPIBQ01892 262 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 SELENBP1Q13228 472 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 MSANTD2Q6P1R3 559 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 MUL1Q969V5 352 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 PHF21AQ96BD5 680 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 ITPAQ9BY32 194 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 NTN4Q9HB63 628 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 MIOSQ9NXC5 875 aa14.97□□□□□ -0.01
USP25-201ENST00000285679 COQ3Q9NZJ6 369 aa14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms