RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266546.10

CLSTN3-201, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLSTN3, Length 4,185 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-201ENST00000266546 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 ING3Q9NXR8 418 aa11.31□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 SESN1Q9Y6P5 492 aa11.31□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa11.31□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 ILVBLA1L0T0 632 aa11.31□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 GNAO1P09471 354 aa11.31□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 ITIH1P19827 911 aa11.31□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 C4BPBP20851 252 aa11.31□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 GPR15P49685 360 aa11.31□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 UFM1P61960 85 aa11.31□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 CNTN1Q12860 1018 aa11.31□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 KLHL12Q53G59 568 aa11.31□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 TRNP1Q6NT89 227 aa11.31□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 SLC2A7Q6PXP3 512 aa11.31□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 TMCO6Q96DC7 493 aa11.31□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF778Q96MU6 729 aa11.31□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 SAMD11Q96NU1 681 aa11.31□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 POLE4Q9NR33 117 aa11.31□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 ARMC1Q9NVT9 282 aa11.31□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 TBC1D14Q9P2M4 693 aa11.31□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 SSR3Q9UNL2 185 aa11.31□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 A0A1B0GW55 424 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 FAM72CH0Y354 149 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 hCG_2039718K7EN88 272 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 ZW10O43264 779 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 TSPAN9O75954 239 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 ATE1O95260 518 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 FABP3P05413 133 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 C8AP07357 584 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 DUX4L2P0CJ85 424 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 DUX4L3P0CJ86 424 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 DUX4L4P0CJ87 422 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 DUX4L5P0CJ88 424 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 DUX4L6P0CJ89 424 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 DUX4L7P0CJ90 424 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 RPL10P27635 214 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 AQP1P29972 269 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 DIO3P55073 304 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 MVKQ03426 396 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 KCNAB2Q13303 367 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF404Q494X3 552 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 SPATS1Q496A3 300 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 FAM72AQ5TYM5 149 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 FAM72DQ6L9T8 149 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 HACD2Q6Y1H2 254 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 USP43Q70EL4 1123 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 FAM72BQ86X60 149 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 ABHD11Q8NFV4 315 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 STARD8Q92502 1023 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 PIK3R3Q92569 461 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 RTP3Q9BQQ7 232 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 FUNDC2Q9BWH2 189 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 MEAF6Q9HAF1 191 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 TMEM248Q9NWD8 314 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 DUX4Q9UBX2 424 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 TBX21Q9UL17 535 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 INSL5Q9Y5Q6 135 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 NOTOA8MTQ0 251 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 LATS1O95835 1130 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 PTPN2P17706 415 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 MC4RP32245 332 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 DGKQP52824 942 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 SPIBQ01892 262 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 PIGFQ07326 219 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 SCN1BQ07699 218 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 LAPTM5Q13571 262 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 PLPP4Q5VZY2 271 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 NEK5Q6P3R8 708 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 PIM3Q86V86 326 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 CACUL1Q86Y37 369 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 GOLM1Q8NBJ4 401 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 LINC01599Q8WXQ3 324 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 KCNA7Q96RP8 456 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 TM6SF2Q9BZW4 377 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 SP140LQ9H930 580 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 NMUR1Q9HB89 426 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 A8MX80 341 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 M0QX08 132 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 TBL1XO60907 577 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 IGSF6O95976 241 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 PRKACGP22612 351 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 IRF8Q02556 426 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 TPRG1LQ5T0D9 272 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 ADGRF1Q5T601 910 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 CEP97Q8IW35 865 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 MINDY1Q8N5J2 469 aa11.3□□□□□ -0.6
CLSTN3-201ENST00000266546 ARNTL2Q8WYA1 636 aa11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms