RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 WNT16Q9UBV4 365 aa19.89■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 FBXL21Q9UKT6 434 aa19.89■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 MMP17Q9ULZ9 603 aa19.89■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 CRYL1Q9Y2S2 319 aa19.89■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1W2PP55 124 aa19.88■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 H0Y858 1186 aa19.88■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 NFATC3Q12968 1075 aa19.88■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 CYP2R1Q6VVX0 501 aa19.88■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 TAS2R42Q7RTR8 314 aa19.88■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 HDDC3Q8N4P3 179 aa19.88■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 RAB7BQ96AH8 199 aa19.88■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 ASB9Q96DX5 294 aa19.88■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 ASB8Q9H765 288 aa19.88■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 HDAC3O15379 428 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 AKAP10O43572 662 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 ITGALP20701 1170 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 RPL14P50914 215 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 PTPN5P54829 565 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 TAS2R38P59533 333 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 NEDD8Q15843 81 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 SEL1L3Q68CR1 1132 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 HMBOX1Q6NT76 420 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 CHSY3Q70JA7 882 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 SNX20Q7Z614 316 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 EHD1Q9H4M9 534 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 SIAEQ9HAT2 523 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 SLC39A10Q9ULF5 831 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 TTKP33981 857 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 GLRBP48167 497 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 RHDQ02161 417 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM52BQ4KMG9 183 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 CADM3Q8N126 398 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 LPGAT1Q92604 370 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 SCAMP4Q969E2 229 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 SLCO4A1Q96BD0 722 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 TCF12Q99081 682 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 RIC8BQ9NVN3 520 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 SMOXQ9NWM0 555 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 RAP2CQ9Y3L5 183 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 SAC3D1A6NKF1 404 aa19.86■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 PSMD11O00231 422 aa19.86■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 JUNP05412 331 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 TFEBP19484 476 aa19.86■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 TTPAP49638 278 aa19.86■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 CLCN5P51795 746 aa19.86■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 DCDC1P59894 354 aa19.86■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 ACOX1Q15067 660 aa19.86■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa19.86■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 ELMO2Q96JJ3 720 aa19.86■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 COQ10AQ96MF6 247 aa19.86■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa19.86■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa19.86■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa19.86■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 GRID2O43424 1007 aa19.86■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 TIPRLO75663 272 aa19.86■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 CCNA2P20248 432 aa19.86■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 STARD6P59095 220 aa19.86■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 PERM1Q5SV97 790 aa19.86■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF549Q6P9A3 640 aa19.86■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 SIX5Q8N196 739 aa19.86■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 OMDQ99983 421 aa19.86■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 C1orf50Q9BV19 199 aa19.86■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 LTB4R2Q9NPC1 389 aa19.86■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 OR1I1O60431 355 aa19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 MMP20O60882 483 aa19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 NDUFS3O75489 264 aa19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 BCL10O95999 233 aa19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 DNTTP04053 509 aa19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 C6P13671 934 aa19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 NAGLUP54802 743 aa19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 USP10Q14694 798 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP19.85■□□□□ 0.772e-20■■■■□ 19.3
UBE2B-201ENST00000265339 CRY1Q16526 586 aa19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 LDLRAP1Q5SW96 308 aa19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 KCTD8Q6ZWB6 473 aa19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 SERPINA9Q86WD7 417 aa19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 MRGPRX1Q96LB2 322 aa19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 FOXQ1Q9C009 403 aa19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 FAM83DQ9H4H8 585 aa19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 LMAN1LQ9HAT1 526 aa19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 FBXL12Q9NXK8 326 aa19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
UBE2B-201ENST00000265339 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms