RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 PAQR3Q6TCH7 311 aa21.58■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 STRA8Q7Z7C7 330 aa21.58■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 CPNE9Q8IYJ1 553 aa21.58■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 DENND1AQ8TEH3 1009 aa21.58■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 UBXN4Q92575 508 aa21.58■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 OR2A14Q96R47 310 aa21.58■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 PITPNM3Q9BZ71 974 aa21.58■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 FAM129AQ9BZQ8 928 aa21.58■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 APMAPQ9HDC9 416 aa21.58■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 FBXO8Q9NRD0 319 aa21.58■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 ACTR10Q9NZ32 417 aa21.58■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 OR6C2Q9NZP2 312 aa21.58■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 VWA7Q9Y334 891 aa21.58■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa21.58■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa21.58■■□□□ 1.05
SYF2-201ENST00000236273 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 ARHGEF33A8MVX0 844 aa21.57■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 GFYI3L273 518 aa21.57■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 MPC1LP0DKB6 136 aa21.57■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 RAB28P51157 221 aa21.57■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 TTLL9Q3SXZ7 439 aa21.57■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 FAM129CQ86XR2 697 aa21.57■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 RELL1Q8IUW5 271 aa21.57■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa21.57■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 ASB11Q8WXH4 323 aa21.57■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 IFT81Q8WYA0 676 aa21.57■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 SPRY4Q9C004 299 aa21.57■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 SLC39A1Q9NY26 324 aa21.57■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 TAS2R13Q9NYV9 303 aa21.57■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 SDK2Q58EX2 2172 aa21.57■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 GSAPA4D1B5 854 aa21.56■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 MATN2O00339 956 aa21.56■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 RASGRF2O14827 1237 aa21.56■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 TSPAN12O95859 305 aa21.56■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 RPN2P04844 631 aa21.56■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 CBSLP0DN79 551 aa21.56■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 MCM3P25205 808 aa21.56■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 CBSP35520 551 aa21.56■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 PRKAA1Q13131 559 aa21.56■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 ANKS6Q68DC2 871 aa21.56■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 ARMC6Q6NXE6 501 aa21.56■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 TMEM207Q6UWW9 146 aa21.56■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 CARFQ8N187 725 aa21.56■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 GPATCH11Q8N954 259 aa21.56■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 DLG3Q92796 817 aa21.56■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 RAD51AP1Q96B01 352 aa21.56■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 CTRCQ99895 268 aa21.56■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 C1GALT1Q9NS00 363 aa21.56■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 DSPP15924 2871 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 A0A087WV48 116 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 PIPSLA2A3N6 862 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 C2orf74A8MZ97 194 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 FOLR1P15328 257 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 UGT2B7P16662 529 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 CCNFP41002 786 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 KCNAB1Q14722 419 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 KMT5CQ86Y97 462 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 D2HGDHQ8N465 521 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 OR2L8Q8NGY9 312 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 FOPNLQ96NB1 174 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 DDA1Q9BW61 102 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 SSUH2Q9Y2M2 353 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 MYO1CO00159 1063 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 ST6GAL1P15907 406 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 FAM45BPQ6NSW5 357 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 UGT3A1Q6NUS8 523 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 SPESP1Q6UW49 350 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 TRIM73Q86UV7 250 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 HMGCLL1Q8TB92 370 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 FAM45AQ8TCE6 357 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 FBF1Q8TES7 1133 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 RHOJQ9H4E5 214 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 NINJ2Q9NZG7 142 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 BTRCQ9Y297 605 aa21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 PKD1L2Q7Z442 2459 aa21.54■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 ERGP11308 486 aa21.54■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 PVRP15151 417 aa21.54■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 TAS2R39P59534 338 aa21.54■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 HSD11B2P80365 405 aa21.54■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 CYP2A13Q16696 494 aa21.54■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 ZFAND4Q86XD8 727 aa21.54■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 DTX1Q86Y01 620 aa21.54■■□□□ 1.04
SYF2-201ENST00000236273 ZNF248Q8NDW4 579 aa21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms