RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635397.1

SMARCA2-241, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, humanhuman

TSL 4

Gene SMARCA2, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2-241ENST00000635397 SSMEM1Q8WWF3 244 aa5.1□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 IGSF21Q96ID5 467 aa5.1□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 LYZL4Q96KX0 146 aa5.1□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 TUBA1CQ9BQE3 449 aa5.1□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.1□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC38A7Q9NVC3 462 aa5.1□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 B3GAT1Q9P2W7 334 aa5.1□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 DNAJB9Q9UBS3 223 aa5.1□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 POLLQ9UGP5 575 aa5.1□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 A0A087WV48 116 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 PLSCR5A0PG75 271 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 HTR3EA5X5Y0 456 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 PRR32B1ATL7 298 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 AP5Z1O43299 807 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 PPP1R3DO95685 299 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 IGHV2-70P01814 119 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 T-ENOLP0DO92 83 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 SNHG28P0DPA3 235 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 PLA2G2AP14555 144 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 PSMA3P25788 255 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 CRKLP46109 303 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 LHX1P48742 406 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 THBS3P49746 956 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 MBTD1Q05BQ5 628 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 MFAP5Q13361 173 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 TUBB2AQ13885 445 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 TCTE1Q5JU00 501 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 SFMBT2Q5VUG0 894 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 LINGO4Q6UY18 593 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 KCTD8Q6ZWB6 473 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 SECTM1Q8WVN6 248 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 SORCS1Q8WY21 1168 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 MR1Q95460 341 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 IL17FQ96PD4 163 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 DUX5Q96PT3 197 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 INTS14Q96SY0 518 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 TUBB2BQ9BVA1 445 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 VN1R1Q9GZP7 353 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 HIPK2Q9H2X6 1198 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 TRPV4Q9HBA0 871 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 CD93Q9NPY3 652 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 OLFML3Q9NRN5 406 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 SERINC1Q9NRX5 453 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 PTTG2Q9NZH5 202 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 SNX7Q9UNH6 387 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCA2-241ENST00000635397 ENO4A6NNW6 628 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 INSIG1O15503 277 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 SYNGR3O43761 229 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 GOSR1O95249 250 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 BAG4O95429 457 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 WDPCPO95876 746 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 SMIM18P0DKX4 95 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 SAGP10523 405 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC6A6P31641 620 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 ATP6V1E1P36543 226 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 CLK1P49759 484 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 THOP1P52888 689 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 CX3CL1P78423 397 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 DMPKQ09013 629 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 CUL3Q13618 768 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 E2F5Q15329 346 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 SYT14P1Q58G82 188 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 SIRPB2Q5JXA9 342 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 PDSS1Q5T2R2 415 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 C9orf57Q5W0N0 161 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 FAM91A1Q658Y4 838 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 NUP54Q7Z3B4 507 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC9B2Q86UD5 537 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 FAM219AQ8IW50 185 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 UNC45BQ8IWX7 931 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 CCDC170Q8IYT3 715 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 TRIML1Q8N9V2 468 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 MGARPQ8TDB4 240 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 CCDC107Q8WV48 283 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 DHX58Q96C10 678 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 ERO1AQ96HE7 468 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 HES6Q96HZ4 224 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 SGK494Q96LW2 274 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 FN3KQ9H479 309 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 A0A1W2PRB8 838 aa5.07□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 E9PI62 339 aa5.07□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 TULP2O00295 520 aa5.07□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 PSMD14O00487 310 aa5.07□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
SMARCA2-241ENST00000635397 MOCS3O95396 460 aa5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms