RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 NDC1Q9BTX1 674 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 TRHDEQ9UKU6 1024 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 ICKQ9UPZ9 632 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 HCRTR1O43613 425 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 ANXA9O76027 345 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 CRTAMO95727 393 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 ZIC1Q15915 447 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC6A20Q9NP91 592 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 CDC23Q9UJX2 597 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-217ENST00000629983 E2F3O00716 465 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 CTSBP07858 339 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 EDN3P14138 238 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 ALAS2P22557 587 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 SHMT2P34897 504 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC1A1P43005 524 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 TLDC1Q6P9B6 456 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 SNX20Q7Z614 316 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 LUZP1Q86V48 1076 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM151BQ8IW70 566 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 AGAP4Q96P64 663 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 GBA3Q9H227 469 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 EPS8L2Q9H6S3 715 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 RUBCNLQ9H714 662 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 CROCCQ5TZA2 2017 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 CSMD1Q96PZ7 3565 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0J9YY10 115 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 CCL22O00626 93 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 COMTP21964 271 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 TSFMP43897 325 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 RPA4Q13156 261 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 OLIG2Q13516 323 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 UNC5AQ6ZN44 842 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 FJX1Q86VR8 437 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 MCEMP1Q8IX19 187 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5AR1Q8NGP9 310 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 COG1Q8WTW3 980 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2A14Q96R47 310 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 ASF1AQ9Y294 204 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 HACD1B0YJ81 288 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 H3BMH7 237 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 H7C0C1 242 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP5OP48047 213 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 GABRA4P48169 554 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM180AQ6UWF9 173 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 TAS2R42Q7RTR8 314 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC50Q8IVM0 306 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 FAR1Q8WVX9 515 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 C10orf88Q9H8K7 445 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 SPHK1Q9NYA1 384 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 AGAP14A8MT82 685 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 MC4RP32245 332 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 PARP9Q8IXQ6 854 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 SPTLC3Q9NUV7 552 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 IFNKQ9P0W0 207 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 COPG2Q9UBF2 871 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 PLCL2Q9UPR0 1127 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 POLEQ07864 2286 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GUH1 482 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 ISM1B1AKI9 464 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 MMP11P24347 488 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 RIPPLY3P57055 190 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 PRPSAP1Q14558 356 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 TAZQ16635 292 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 TFDP3Q5H9I0 405 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 DLG3Q92796 817 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 SEC16AO15027 2179 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 RBL1P28749 1068 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 BRD3Q15059 726 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 TLR1Q15399 786 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR33Q49SQ1 333 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC181Q5TID7 509 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 RANBP10Q6VN20 620 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 TTLL10Q6ZVT0 673 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 SERPINA9Q86WD7 417 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 CLDN19Q8N6F1 224 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 FERMT1Q9BQL6 677 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 GORASP1Q9BQQ3 440 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 PLAGL1Q9UM63 463 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-217ENST00000629983 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 PSTPIP1O43586 416 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-217ENST00000629983 ACRV1P26436 265 aa26.32■■□□□ 1.8
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