RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586900.1

PKN1-208, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 3

Gene PKN1, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-208	ENST00000586900	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	LCN9	Q8WX39	176 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	ISL2	Q96A47	359 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	LINGO1	Q96FE5	620 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	HGH1	Q9BTY7	390 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	GPAM	Q9HCL2	828 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	OGFR	Q9NZT2	677 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	PDP2	Q9P2J9	529 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	PTPRB	P23467	1997 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	OR5K3	A6NET4	321 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	MATN2	O00339	956 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	KRT37	O76014	449 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	C9	P02748	559 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	NUDT17	P0C025	328 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	TPBGL	P0DKB5	382 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	GCA	P28676	217 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	CAPZB	P47756	277 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	RAB28	P51157	221 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	CFHR1	Q03591	330 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	RASA2	Q15283	850 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	MROH9	Q5TGP6	573 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	HES3	Q5TGS1	186 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	OOSP2	Q86WS3	158 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	TDRP	Q86YL5	185 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	NCSTN	Q92542	709 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	MTBP	Q96DY7	904 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	TMEM74	Q96NL1	305 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	MENT	Q9BUN1	341 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	DERL2	Q9GZP9	239 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	ICK	Q9UPZ9	632 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	CCDC151	A5D8V7	595 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	MYO1C	O00159	1063 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	RASGRF2	O14827	1237 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	ERLIN1	O75477	346 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	ADRB1	P08588	477 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	JUP	P14923	745 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	TYRP1	P17643	537 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	CYP2A7	P20853	494 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	PKLR	P30613	574 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	CCKBR	P32239	447 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	HSD17B2	P37059	387 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	MAGEA12	P43365	314 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	SERPINB8	P50452	374 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	PGGT1B	P53609	377 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	ATP6V0D1	P61421	351 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	PRKAA1	Q13131	559 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF460	Q14592	562 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	USP53	Q70EK8	1073 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	CARF	Q8N187	725 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	RSC1A1	Q92681	617 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	CD180	Q99467	661 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	RDH14	Q9HBH5	336 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PKN1-208	ENST00000586900	PARVB	Q9HBI1	364 aa		11.96	□□□□□ -0.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms