RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 FCGR1BQ92637 280 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 PIGKQ92643 395 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 CAVIN3Q969G5 261 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 ULK4Q96C45 1275 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 HAVCR1Q96D42 359 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC41A3Q96GZ6 507 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 SENP8Q96LD8 212 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 APOLD1Q96LR9 279 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM68Q96MH6 324 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 LRRC3BQ96PB8 259 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 FCRL4Q96PJ5 515 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF577Q9BSK1 485 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 NTMT1Q9BV86 223 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 KATNB1Q9BVA0 655 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 NUP58Q9BVL2 599 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 SPATA16Q9BXB7 569 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 NAPBQ9H115 298 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 BLZF1Q9H2G9 400 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM245Q9H330 911 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 PDZD7Q9H5P4 517 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 EVA1AQ9H8M9 152 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 TRPC7Q9HCX4 862 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 PNPLA3Q9NST1 481 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 SETD4Q9NVD3 440 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 FBXO34Q9NWN3 711 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 BABAM1Q9NWV8 329 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 P4HTMQ9NXG6 502 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 GTSE1Q9NYZ3 720 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 KLHL9Q9P2J3 617 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 C11orf21Q9P2W6 132 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 HSPB7Q9UBY9 170 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC12A4Q9UP95 1085 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 PLCL2Q9UPR0 1127 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 RCE1Q9Y256 329 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa3.47□□□□□ -1.85
SYF2P1-201ENST00000550658 KIF27Q86VH2 1401 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 A0A0U1RQJ8 604 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 WDR91A4D1P6 747 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 BTBD17A6NE02 478 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 C4orf47A7E2U8 309 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 TLR4O00206 839 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 CHADO15335 359 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ARHGEF9O43307 516 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 CTIFO43310 598 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF208O43345 1280 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 DCXO43602 365 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ATP6V1G1O75348 118 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 MOSPD3O75425 235 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 VPS26AO75436 327 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 CBR3O75828 277 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ATP5HO75947 161 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 DFFBO76075 338 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 MYO1DO94832 1006 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 CDK14O94921 469 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 GLCEO94923 617 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 OR6A2O95222 327 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 GAS8O95995 478 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 NDUFB10O96000 172 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM90A13PP0C7W8 464 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM90A24PP0C7X0 464 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 STAG3L2P0CL84 134 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 OR8G3PP0DMU2 310 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 RAP2AP10114 183 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 CYP4B1P13584 511 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ATP5JP18859 108 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 HK1P19367 917 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 MMP8P22894 467 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 CDAP32320 146 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC16A2P36021 539 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ALDH1A3P47895 512 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 PGDP52209 483 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 MVDP53602 400 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 GSCP56915 257 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 RWDD2BP57060 319 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 SELENOVP59797 346 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 MYL6P60660 151 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 VBP1P61758 197 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 TGM3Q08188 693 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 RESTQ13127 1097 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 PDIA5Q14554 519 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms