RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546048.5

MDM2-234, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5

Gene MDM2, Length 363 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-234	ENST00000546048	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	SLC38A3	Q99624	504 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	CTRC	Q99895	268 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	SPRY4	Q9C004	299 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	PRORY	Q9H606	182 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	SNX12	Q9UMY4	172 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	CACNA1G	O43497	2377 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048		A0A0G2JNG1	304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	MGAT4D	A6NG13	374 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	EFCAB7	A8K855	629 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	BTN3A3	O00478	584 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	HCRTR1	O43613	425 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	PPFIA2	O75334	1257 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	CRTAM	O95727	393 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	KRT14	P02533	472 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	C9	P02748	559 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	MSH3	P20585	1137 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	ITGAL	P20701	1170 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	IDS	P22304	550 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	F8A1	P23610	371 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	ADRA1D	P25100	572 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	ACADL	P28330	430 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	CCR7	P32248	378 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	MAGEA3	P43357	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	MAGEA6	P43360	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	PRLHR	P49683	370 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	PGGT1B	P53609	377 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	MAPK10	P53779	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	CYP4F2	P78329	520 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62	3e-6	■■■■□ 19.3
MDM2-234	ENST00000546048	ID3	Q02535	119 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	CACNG1	Q06432	222 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	CDH17	Q12864	832 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	GPS1	Q13098	491 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	PRKG2	Q13237	762 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	CDK5R2	Q13319	367 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	KCNAB1	Q14722	419 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	KIR2DS5	Q14953	304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	TRADD	Q15628	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	MAP9	Q49MG5	647 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	ANKS6	Q68DC2	871 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	PIM3	Q86V86	326 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	KRT222	Q8N1A0	295 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	ART4	Q93070	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	PBK	Q96KB5	322 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	TGM7	Q96PF1	710 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	RANBP9	Q96S59	729 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	COPS8	Q99627	209 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	KIFC1	Q9BW19	673 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	XKR8	Q9H6D3	395 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	COG4	Q9H9E3	785 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	PAK5	Q9P286	719 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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